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根本來源是基因突變 。因為可遺傳的變異有三種來源：基因突變，基因重組，染色體變異 。但是后兩種變異只是染色體之間的重組、互換，從根本上來說只是基因突變在時間上的積累 。
【變異的根本來源是什么】1個基因內部可以遺傳的結構的改變 。又稱為點突變 ， 通?？梢鹨欢ǖ谋硇妥兓?。廣義的突變包括染色體畸變 。狹義的突變專指點突變 。實際上畸變和點突變的界限并不明確 ， 特別是微細的畸變更是如此 。野生型基因通過突變成為突變型基因 。突變型一詞既指突變基因，也指具有這一突變基因的個體 。
基因突變可以發生在發育的任何時期，通常發生在DNA復制時期，即細胞分裂間期，包括有絲分裂間期和減數分裂間期;同時基因突變和脫氧核糖核酸的復制、DNA損傷修復、癌變和衰老都有關系，基因突變也是生物進化的重要因素之一，所以研究基因突變除了本身的理論意義以外還有廣泛的生物學意義 。基因突變為遺傳學研究提供突變型，為育種工作提供素材，所以它還有科學研究和生產上的實際意義 。