生物進化的實質是基因頻率的定向改變 。
自然選擇是唯一持續導致適應性進化的機制，根據表現型在不同環境里的適應性，它通過三種不同模式改變可遺傳性狀在種群里的基因頻率：
1、定向選擇，當一種極端的表現型更適應環境時，種群的基因頻率向特定方向移動
2、淘汰選擇，當表現型的兩個極端都適應環境，而過渡型不適應時，基因頻率同時分別向兩個方向移動
3、穩定型選擇，與2相反，不選擇表現型的兩種極端而更偏向過渡型，此模式減少變種而保持某一特定性狀的穩定性 。
【生物進化標志】由此，生物進化的過程為從變異產生到自然選擇，再到基因頻率定向改變，生物進化 。

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