使用熒光顯微鏡的注意事項如下：
【熒光顯微鏡的使用注意事項】嚴格按照熒光顯微鏡出廠說明書要求進行操作，不要隨意改變程序；應在暗室中進行檢查 。進入暗室后，接上電源，打開超高壓汞燈5至15分鐘，待光源發出強光穩定后，眼睛完全適應暗室，再開始觀察標本；防止紫外線對眼睛的損害，在調整淘汰時應戴上防護眼鏡；檢查觀察時間每次以1到2小時為宜，超過90分鐘，超高壓汞燈發光強度逐漸下降，熒光減弱；熒光顯微鏡光源壽命有限，標本應集中檢查，以節省時間，保護光源；標本染色后應立即觀察，因時間久了熒光會逐漸減弱 。
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