鎂離子在PCR中的作用是與dNTP、核酸骨架相互作用，影響Polymerase的活性 。
鎂離子濃度對PCR擴增效率影響很大，濃度過高可降低PCR擴增的特異性，濃度過低則影響PCR擴增產量，甚至使PCR擴增失敗而不出擴增條帶；
【鎂離子在PCR中的作用】一般鎂離子的濃度在0.5毫摩爾每升到5毫摩爾每升之間，調整dNTP的濃度后要相應的調整鎂離子的濃度 。
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