【化學滲透假說的主要內容】電子傳遞鏈各組分在線粒體內膜中不對稱分布 ， 當高能電子沿其傳遞時 ， 所釋放的能量將氫離子從基質泵到膜間隙，形成氫離子電化學梯度 。在這個梯度驅使下,氫離子穿過ATP合成酶回到基質,同時合成ATP，電化學梯度中所蘊藏的能量儲存到ATP的高能磷酸鍵，電子及質子通過呼吸鏈上電子載體和氫載體的交替傳遞,在線粒體內膜上形成3次回路，導致3對氫離子抽提至膜間隙，生成3個ATP分子 。
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