科研干貨Pubmed檢索實用指南 pubmed高級檢索方法


科研干貨Pubmed檢索實用指南 pubmed高級檢索方法

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作者:解螺旋.小米
如需轉載請注明來源:解螺旋·醫生科研助手
·導語·
Pubmed是國際上公認的最具權威的生物醫學文獻數據庫 , 檢索文獻用Pubmed , 一般人都知道 。不過解螺旋還是會經常收到讀者關于Pubmed和文獻檢索各種各樣的問題 , 今天咱們就一次性解決問題 , 把Pubmed的基本、高級和精準檢索功能做個梳理 , 大家各取所需吧 。
基本檢索功能
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呦 , 還不一樣?對于輸入Pubmed的多詞詞組 , 它會查詢詞組索引 , 如果查到相應詞組會將其作為一個檢索詞來檢索 , 如果沒有查到相應詞組 , 則將其拆分成單個詞分別檢索 。所以liver cancer lncRNA就相當于Liver AND cancer AND lncRNA , 我不想把詞組分開咋辦?可以通過以下方法:
加雙引號:“liver cancer”“lncRNA”
加標段標識[tw]:liver cancer[tw] lncRNA
加短橫線“-”:liver-cancer lncRNA
加截詞符“*”:liver cancer* lncRNA
如果檢索完畢你對這篇文章感興趣 , 則直接點擊進入即可:
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左邊是文章摘要和作者信息等 , 右邊兩個紅框是全文鏈接:
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LinkOut-more resources這里也可以鏈接到數據庫哦:
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點擊任意一個進入相應的數據庫 , 會有pdf標識的鏈接 , 然后就能下載啦!
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查詢的關鍵詞類型大致可以分為:
詞語(主題)檢索:在檢索框中直接鍵入英文單詞或短語 , 大小寫都可 。
著者檢索:在檢索框中鍵入著者姓氏全稱和名字的首字母縮寫 , 注意格式為:著者姓空格 名字首字母縮寫" , 如施一公 , shi yg.
刊名檢索:在檢索框中鍵入刊名全稱或medline形式的簡稱、ISSN號 , 例如:molecularbiology of the cell, 或mol biol cell, 或1059-1524 , 然后回車或點擊Go,系統將在刊名字段檢索 , 并顯示檢索結果 。
日期檢索:在檢索框中鍵入日期或日期范圍 , 日期的錄入格式為YYYY/MM/DD;如:1999/09/08;只用年份或年月 , 如:2000或1999/12 。
期刊子集(輯) 檢索:檢索詞ANDjsubseta,如:neoplasm AND jsubseta ??晒z索的期刊子庫有3種:Abridged Index Medicus(有120種重要核心期刊)、Dental和Nursing 。分別使用jsubseta,jsubsetd, jsubsetn進行限定 。
檢索帶文摘的記錄:檢索的格式為:檢索詞AND has abstract, 如:liver cancer ANDhas abstract 。要注意的是在1975年前出版的文章 , 其MEDLINE記錄中沒有文摘 。
布爾邏輯檢索:PubMed系統允許使用布爾邏輯檢索 , 只要在檢索框中鍵入布爾邏輯運算符(AND , OR或NOT) 。具體使用時要注意的問題 , 詳見上第2點所述 。
高級檢索功能
如果你要是有所針對 , 特異性的搜索具體作者、雜志或者其他信息等 , 還可以進行更加高級的檢索 ,  高級檢索技巧有兩個入口:一個入口是通過搜索前的advanced進入 , 就在pubmed首頁搜索框的下面 。
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這里有三個高級搜索選型:
1.是左側的and or not選項 , 很好理解 。
2.是搜索框選型 , fieids , 選擇你需要選擇的搜索范圍 。
3.是index索引 , 以cancer為例 , 點擊list , 出現下圖內容 , 可以很方便的選擇子方向 , 這個選項可以大大的提高我們的檢索效率 , 縮小工作范圍 。
第二個功能入口:是我們搜索之后的界面 , 在左側的選項 。
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還是以cancer為例 , 左側出現了additional filter , 這里我們可以把我們需要的內容進行篩選 , 比如我需要找到臨床試驗類型的文章 , 就在article types 中點擊clinical trial , 需要查看最近5年的文章 , 就選擇publication data 5 years , 等等 。這個功能能夠幫助我們快速的篩選出我們需要的文章類型 , 很好用 。
想要查看pubmed的檢索的詳細內容 , 可以點擊右下側的search details , 點擊see more , 你將會看到pubmed的全部搜索信息 , 同時提供修改 。
精準檢索功能
PubMed上找論文時 , 如果關鍵詞好幾個 , 由于單詞間的空格鍵存在AND命令 , 導致明明要搜的是詞組 , 搜索不是被放大就是縮小 , 很難檢索到合適且關聯度高的文 。例如 , 你想找和腸炎與腫瘤壞死因子相關論文 , 搜索關鍵詞:Inflammatory bowel disease TNF 。結果如下:
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試試搜索關鍵詞:IBD TNF
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如果還想要基因檢測方向的呢?搜關鍵詞:genetic test IBD TNF
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用簡稱縮寫確實一下子就將目標范圍縮小了好幾倍 , 然而很多詞匯并沒有簡稱 , 而且由于單詞間的空格存在AND命令 , 將多個關鍵詞一起輸入時很容易導致找不到 , 需要交集計算的太多啦!找個文獻難不成還要先熟練一下搜索命令又是引號又是括號嗎?當然不用啦 , 又不是程序員!
怎么才能快速搜到我想要的論文呢?別急 , 看看下面在基因檢測方向怎樣快速靶向定位的例子 , 你就一切都了然了 。
1、首先選擇PudMed的使用工具下的臨床資料(Clinical Queries)
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2、輸入一級關鍵詞”IBD”
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3、在左右兩邊的臨床研究目錄以及臨床遺傳學下選擇范圍 , 如病因、診斷、治療、預后和臨床預測指南等 。
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選擇右下的see all , 回到PubMed主頁 。
4、輸入你的二級關鍵詞:TNF , 根據你的需要選擇排序方式 。例如 , 出版時間、關聯度、雜志等 。選擇很多年前的文章作為參考文獻 , 數量就不能多!如果五年十年前的參考文獻超過70% , 這是打算寫給誰看呢?
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OK啦 , 你的目的達到了 。
除此之外 , 你也可以通過布爾(BOOLEAN)運算來提高你的效率 , 最常用的三種布爾運算即是AND,OR和NOT 。
AND提供的運算方式即不管所輸入的兩個關鍵詞語并列列出 , OR則是將出現至少一個關鍵詞的文章列出 , 這種運算在想將相似主題的文章羅列在一起時 , 十分有效 。NOT運算可以在你的檢索范圍內將某些不需要的部分除去 。
但是在使用的時候要特別注意 , 會有可能將一些你所需要的文章漏掉 。比如當你的檢索詞為LEAD POISONING NOT CHILDREN時 , 除了會刪除掉那些僅討論兒童的文章 , 同時也會刪去那些同時討論兒童及其他年齡組的文章 。
收尾:批量保存和打印文獻
Pubmed建立的生物醫學文獻檢索系統 , 免費文獻比例有限 , 不過一般高校都會買數據庫權限 , 大家在校園局域網內可以任性下載文獻、了解領域內科研前沿 。檢索好自己想要的文獻 , 免不了要收藏保存 。打開Summary下拉菜單選擇其中一種格式 , 然后點擊Save鍵;要保存特定記錄時 , 點擊記錄左邊的選擇框予以標記后 , 再點擊Save鍵 。
使用瀏覽器的打印功能 , 即可把感興趣的內容打印出來 。系統允許每頁最多顯示500條記錄 。如果想打印成文本格式 , 請先點擊Text鍵 , 然后再打印 。到這 pubmed檢索的一些基本功能 , 了解更深入的功能請繼續關注解螺旋 。
編后語:
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【科研干貨Pubmed檢索實用指南 pubmed高級檢索方法】解旋螺——取解構基礎與臨床雙螺旋人生之意 。我們旨在傳播臨床基礎科研中有益的方法論 , 通過經驗和信息的分享積累學術能力 。從零基礎到初窺門徑 , 從初窺門徑到游刃有余 , 一路相伴 。做或不做科研 , 從醫之路大不同;關注或不關注解螺旋 , 科研之路大不同 。
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