經營方式不同、兩者扣點不同、利潤來源不同 。
經營方式不同 。京東自營店是京東商城自己獨自運營的店鋪，自己進貨，自己經營 。京東直營店則是京東商城將一部分店鋪以出租的形式給第三方經營，叫非自營店 。而京東只是負責提供一個雙方買賣的平臺，其他的品牌商進來的店鋪 ， 叫京東自營店 。
【京東直營店跟自營店有什么區別】兩者扣點不同 。第三方店鋪京東的扣點不多，也就是說商家的利潤多些，隨之而來的就是流量也不多 。銷量不容易上去 。
利潤來源不同 。商家把產品提供給京東自營，供貨價不高，等于把零售利潤出讓了一部分給京東 。換來的是流量大 ， 可以上他們的各種活動，銷量當然也很大 。也就是說商家通過供貨給京東自營 ， 損失了一部分利潤，換來了產品的高曝光率和銷量 。

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