兩個具有不同遺傳性狀的細胞 ， 采用適宜的水解酶溶解細胞壁后，在自發情況或融合劑作用下，兩個原生質體接觸，融合成為異核體，經過繁殖復制進一步核融合，形成雜合二倍體，再經過染色體交換產生重組體，達到基因重組的目的，并在適宜的條件下再生出細胞壁 ， 對重組體進行生產性能、生理生化和遺傳特性分析獲得所需重組子 。
【原生質體融合原理】其中，細胞在用酶分離原生質體過程中發生的原生質體自然融合現象又稱自發融合；而分離原生質體以后，通過加入誘導劑或利用其他方法誘導不同親本原生質體發生融合的過程又稱誘導融合 。理版論上講原生質體融合可在包括種內、種間、屬間、科間甚至是界間的任何原生質體間進行，它不僅可以突破物種間的生殖隔離，創造遠緣雜種；還可以使雙親的細胞質基因結合在一起，從而達到改良由胞質基因控制的性狀的目的權 。

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