1、當目的基因的序列已知時：用化學方法合成目的基因，或用聚合酶鏈式反應（PCR）擴增目的基因 。
將含有某種生物的許多DNA片段，導入受體菌的群體中儲存 。各個受體菌分別含有這種生物不同的基因，稱為基因文庫 。當需要某一片段時，根據目的基因的有關信息來獲取目的基因 。如根據基因的核苷酸序列、基因的功能、基因在染色體上的位置、基因的轉錄產物mRNA，以及基因的表達產物蛋白質等特性來獲取目的基因 。
2、當目的基因序列未知時：建立一個包括目的基因在內的基因文庫，從基因文庫中提取目的基因 。
【目的基因的獲取方法】3、用PCR技術擴增技術提取 。已知目的基因引物的序列，將整個DNA放入合成儀 。只有引物中間的目的基因被大量擴增，即被提取出來 。
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