小兒癤瘡及痱子 ， 用藿香正氣水、注射用水各10毫升 ， 混合一起，備用，用生理鹽水沖洗消毒癤瘡及痱子局部，然后涂擦此藥，每日3～4次 ， 1周后即可治愈 。
濕疹 ， 每日用溫水清洗患處后 ， 直接用藿香正氣水外涂患處，天天3～5次 ， 連用3～5天 。
醫學認為頭癬、手足癬、灰指甲 皮膚癬、灰指甲由皮膚癬菌感染引起，夏季常易復發，而組成藿香正氣水的藿香、紫蘇、白芷、桔梗分別對多種致病真菌有較強的抑制作用，故而在臨床中治療頭癬、手足癬、灰指甲有較好的療效 。用藿香正氣水涂擦患處，每日1～2次，也可每日多擦幾次 。5天為一療程，一般1～2個療程即可見效 。
暈車暈船 乘坐車、船前，可用藥棉蘸取藿香正氣水敷于肚臍內，也可在乘車前5分鐘口服一支藿香正氣水(兒童酌減)，可預防暈車暈船 。
外陰瘙癢：用藿香正氣水10毫升 ， 涼開水500毫升，混合后清洗外陰，男女皆可應用 。
【藿香正氣水可治灰指甲】蚊蟲叮咬：藿香正氣水還可治蚊蟲叮咬，涂藥半小時左右瘙癢可減輕或消失 。