空氣里含有二氧化碳，常見石頭的主要成分是碳酸鈣，下落的水滴伴隨著二氧化碳，和碳酸鈣發生化學反應 ， 生成可溶于水的碳酸氫鈣；自然界里的水一般呈酸性 ， 也能和碳酸鈣產生化學反應 ， 從而導致水滴石穿 。
在深山老林看看那些長年累月遭到水滴的大石頭，就會發現有很多凹陷 ， 這就是水滴石穿的證明 。
從化學角度來講，地球中存在著一定的二氧化碳，部分溶于雨水中，水中含酸性物質，與石頭中的碳酸鹽反應生成可溶解的碳酸氫鹽 ， 然后又被后來滴上的水沖走，這樣往復，石頭不斷被腐蝕，最終會被滴穿 。
水滴石穿還依賴于水中酸的作用，從物理角度來講，水滴落到石頭上時，水滴首先被碰扁，然后向四周散落開來，就在水滴落地與散開一瞬間，在水滴和石頭間形成了無數細小的氣泡，由于水的表面的張力作用，這些氣泡的表面積都要盡可能收縮到最小 。
氣泡收縮時壓縮氣泡內部的空氣 ， 使氣泡內的空氣有較大的壓強 ， 氣泡半徑越小 ， 氣泡內的氣體壓強就越大 。
【滴水為什么能穿石】當這些半徑很小的氣泡破裂時 ， 內部的高壓氣體沖擊石頭 ， 造成了石頭的微小損傷，從而日積月累，水滴石穿 。
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