【掃描隧道顯微鏡工作原理】當原子尺度的針尖在不到一個納米的高度上掃描樣品時，此處電子云重疊，外加一電壓，針尖與樣品之間產生隧道效應而有電子逸出，形成隧道電流 。電流強度和針尖與樣品間的距離有函數關系，當探針沿物質表面按給定高度掃描時 ， 因樣品表面原子凹凸不平，使探針與物質表面間的距離不斷發生改變，從而引起電流不斷發生改變 。
它作為一種掃描探針顯微術工具，掃描隧道顯微鏡可以讓科學家觀察和定位單個原子，它具有比它的同類原子力顯微鏡更加高的分辨率 。此外，掃描隧道顯微鏡在低溫下可以利用探針尖端精確操縱原子，因此它在納米科技既是重要的測量工具又是加工工具 。

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