《女醫明醫傳》結局是祁鈺在除夕夜病逝，允賢逃脫了殉葬的命運 ， 卻意外地失去了腹中的孩子，之后便離開了皇宮，遠走天涯，十年之后朱祁鎮找到了允賢 。
【女醫明醫傳結局是什么】允賢還是沒能保住她與祁鈺唯一的孩子，不幸小產 。此時的朱祁鎮在孫太后與百官的哄騙支持之下，無奈即位 ， 危難之中重新擔起了大明的重任 。為了皇后為了太子，更為了江山社稷與天下百姓 ， 朱祁鎮必須放棄私心，重新回歸那座高位 。
此時的允賢也終于走出皇宮的高墻，在江湖之中找到了真正屬于自己的位置，將她濟世濟民、行醫救人的理想付諸了行動 。這樣的快樂讓她終于得以忘記了失去愛人孩子的痛苦，實現了自我的價值 。
這一次，朱祁鎮等來了與愛人相伴，攜手一生的機會 。當他推開允賢醫館的大門，二人四目相對的一刻，不需要任何言語，暖暖的溫情已然流淌在他們的心間 。歷盡世間滄桑的這對愛人 ， 終于迎來了他們幸福的未來 。