激酶|《自然》:腸菌“鈍化”降糖藥!科學家首次發現,口腔和腸道中特定微生物為了生存,能表達讓阿卡波糖失活的酶丨科學大發現

阿卡波糖 , 2型糖尿病常用的降糖藥 , 萬萬沒想到還是被腸道菌群打敗了 。
美國普林斯頓大學的Mohamed S. Donia教授及其團隊和其他合作單位 , 在頂級期刊 《自然》雜志上發表重要研究成果[1] 。
他們通過宏基因組測序結合生物化學以及結構學等實驗分析 , 發現 部分人群的口腔和腸道中天然存在抑制阿卡波糖活性的細菌 , 它們 通過表達阿卡波糖磷酸酶使之失活 , 減弱了阿卡波糖控制血糖的效果 。

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▲ 文章封面截圖
【激酶|《自然》:腸菌“鈍化”降糖藥!科學家首次發現,口腔和腸道中特定微生物為了生存,能表達讓阿卡波糖失活的酶丨科學大發現】2019年在中國市場銷售額達75億的阿卡波糖片 , 糖尿病患者肯定不會陌生 。 其成分阿卡波糖是一種復雜低聚糖 ,可以競爭性結合腸道中的α-葡萄糖苷酶(包括唾液淀粉酶和胰淀粉酶)并抑制其活性 , 從而中止或減緩麥芽糖、異麥芽糖、淀粉及蔗糖等碳水化合物的分解 , 降低產物葡萄糖的形成和吸收 , 緩解餐后高血糖 , 達到降低血糖的作用[2] 。
阿卡波糖本身無法被人體吸收或利用 , 僅在腸腔中發揮作用 。 然而除了人體細胞之外 ,腸道菌群也可以表達α-葡萄糖苷酶 , 這么一來這些細菌對碳水化合物的利用也受到了阿卡波糖影響 。 科學家們已經發現 , 服用阿卡波糖會造成腸道中代謝產物環境的改變 , 影響腸道菌群的結構 。
這真是菌在腸中坐 , 鍋從天上來 。 腸道菌群定然不會坐以待斃 。
果不其然 , 科學家已經發現 有些類別的細菌在病人服用阿卡波糖后的豐度更高[3] , 但具體是哪些菌株通過何種機理適應了新的環境 , 菌群的改變對糖尿病的治療有正面還是負面的影響還不清楚 。

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工業上用來生產阿卡波糖的是一種 放線菌屬的工程菌 Actinoplanes sp. SE50/110 , 它自身可以表達一種阿卡波糖激酶(AcbK) [4] , 對阿卡波糖進行磷酸化從而抑制其活性 , 這樣一來 Actinoplanes sp. SE50/110就可以在生產阿卡波糖的同時 , 正常利用寡糖進行新陳代謝 。
研究人員由此想到的是 , 會不會那些豐度變高的細菌同樣表達了阿卡波糖激酶呢?
NCBI數據庫里已經有大量的人類口腔拭子、生殖道拭子和糞便樣品的宏基因組測序數據 , 在3212份樣品中 , Donia團隊比對出 82種微生物編碼的碳水化合物激酶(基因名mck1-mck82) , 其中3個是土壤微生物表達的阿卡波糖激酶 (基因名AcbK , GacK , ScatK) , 另外有21個碳水化合物激酶和阿卡波糖激酶呈高度同源性 。

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▲ 腸道菌群來源mak基因系統發育樹(左)以及部分Mak磷酸化阿卡波糖的酶催化效率(右)
接下來 , Donia團隊在大腸桿菌種表達了其中9個與阿卡波糖激酶同源的碳水化合物激酶基因 , 并拿到了純化后的蛋白 , 與阿卡波糖和ATP共孵育 , 再用高效液相色譜-質譜聯用 (HPLC-MS)檢測阿卡波糖的磷酸化的速率 。
其中 8個碳水化合物激酶表現出磷酸化阿卡波糖的能力 , 速度分別是陽性對照 Actinoplanes sp. SE50/110來源的阿卡波糖激酶AcbK的1/17到2倍。 這8個基因及其對映的激酶被定義為 腸道菌群來源的阿卡波糖激酶(microbiome-derived acarbose kinases, Maks) 。
當Donia團隊回看這8種經鑒定的maks在那3212份樣品中的陽性率時 , 他們發現在 幾份口腔拭子樣品中存在maks(至少一種)的比率最高 , 能達到59%(144/243)甚至94%(249/264) , 主要來自放線菌門的 Actinomyces oris , 厚壁菌門的 Solobacterium moorei 以及梭桿菌門的 Leptotrichia trevisanii。 Maks在糞便樣品中檢出的比率較低 , 其中mak16是唯一一個只出現在糞便而非口腔樣品的阿卡波糖激酶 , 其來源是厚壁菌門的 Turicibacter sanguinis, 攜帶mak16的糞便樣品約為4-11% 。