微生物的生物氧化可以分為三種形式：呼吸、無氧呼吸和發酵 。呼吸和無樣呼吸的本質是一樣的，底物脫氫后電子經過呼吸鏈產能，能量來源主要是氧化磷酸化 。只不過無樣呼吸電子傳遞給了氧化性的外源物質如硝酸鹽、硫酸鹽等 。
【呼吸作用和發酵的根本區別是什么】發酵是電子不經過電子傳遞鏈，直接交給代謝中間物，如丙酮酸，主要靠底物水平磷酸化產能 。

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