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北大/昌平實驗室聯合團隊最新成果，將為抗新冠病毒添新藥！( 三 )

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北京昌平實驗室、北京大學生物醫學前沿創新中心曹云龍研究員 ， 北京大學博士研究生簡繁沖、王菁、宋瑋良 ， 中國食品藥品檢定研究院于原玲為Nature論文的共同第一作者 。 北京昌平實驗室、北京大學生物醫學前沿創新中心曹云龍研究員、謝曉亮教授、中國食品藥品檢定研究院王佑春研究員為Nature論文的共同通訊作者 。
北京昌平實驗室、北京大學生物醫學前沿創新中心曹云龍研究員 ， 北京大學博士研究生簡繁沖、張志瑩、阿依江·伊斯馬衣 ， 地壇醫院郝曉花博士 ， 北京協和醫學院鮑琳琳研究員為CellReports論文的共同第一作者 。 北京昌平實驗室、北京大學曹云龍研究員、謝曉亮教授、肖俊宇教授 ， 北京協和醫學院秦川教授 ， 地壇醫院金榮華院長為CellReports論文的共同通訊作者 ， 北京大學、昌平實驗室、動物所、中檢院、科興公司等單位的相關科研人員為共同作者 。
本系列研究得到科技部、昌平實驗室基金、國家自然科學基金和北京市科技計劃支持 。
【北大/昌平實驗室聯合團隊最新成果，將為抗新冠病毒添新藥！】專家點評
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清華大學醫學院祁海教授
這一工作深入探究了構成當前新冠大流行的多個奧密克戎毒株對人類群體免疫的逃逸規律 。 曹云龍/謝曉亮聯合團隊發現 ， 多個奧密克戎株亞型在受體結合蛋白上都顯現出相同或類似的逃逸突變 。 這些突變 ， 在保證病毒結合其受體的同時 ， 躲避了之前中和抗體的抑制作用 。 這說明 ， 人群序貫疫苗接種和自然感染所構建起的群體免疫 ， 的確在阻斷并降低既往毒株感染；同時 ， 這種群體免疫的壓力 ， 也為未來病毒變異留下了越來越少的潛在逃逸路徑 。 那么 ， 我們是否可以根據已有的群體免疫狀態和現有毒株的受體結合蛋白 ， 來預測未來最有可能出現的逃逸突變呢？曹云龍/謝曉亮聯合團隊利用他們開發的一種高通量深度突變掃描（DMS）方法 ， 分析、鑒定了BA5和BA2可能逃逸群體免疫的突變 。 非常重要的是 ， 他們預測出來的突變 ， 確實出現在了其它具有流行潛力的毒株上 。 曹云龍/謝曉亮聯合團隊這項研究所提供的這種預測能力 ， 可以幫助我們更高效地設計廣譜抗新冠疫苗 ， 也會使我們更可能為所有潛在逃逸現有群體免疫的毒株準備好“特效藥” 。
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中國科學院生物物理所王祥喜研究員
新冠病毒一直在持續性進化 ， 衍生出多種突變株；然而在奧密克戎出現之后 ， 新冠病毒的演變速度明顯加快 。 近半年來 ， 就有BA.5、BF7、BA.2.75、BQ、XBB等近十種新突變株在一些國家成為主要流行突變株 。 這些新突變株往往其傳染性和抗體逃逸能力都在增強 。 總體來講 ， 人類對新冠病毒的研究是被動地跟著病毒跑 ， 一個新突變株出現后再去了解它的病毒特性 ， 去探究新突變株對現有疫苗和藥物的影響 。 如何前瞻性預測病毒演變的方向 ， 提前預判未來一段時間內可能出現的突變株具有重要的戰略意義 。
2022年12月19日 ， 北京大學謝曉亮/曹云龍團隊聯合中檢院王佑春團隊在Nature上發表題為ImprintedSARS-CoV-2humoralimmunityinducesconvergentOmicronRBDevolution研究論文 ， 這是該團隊繼新冠中和抗體、新冠疫苗效果評估、追蹤新突變株免疫逃逸特性后 ， 又一系統性而創新性工作 。 該項研究有五點重要發現：1）從龐大的數據庫中分析出近期有幾十個新突變株其生長優勢超越BA.5 ， 且這些突變株有一定的共性 ， 在某些特定位點攜帶相同或相似的突變 ， 呈現趨同進化規律；2）這些新突變株展示出極強的抗體逃逸特性 ， 基本逃逸國際上已批準上市的抗體藥物；3）一個抗體對組合SA55/SA58（也是該團隊的研究成果）依然高效中和這些新突變株；4）從原始株感染康復者、BA.1/BA.2/BA.5突破感染者等不同免疫背景分離2000余株抗體 ， 并繪制出不同免疫背景下抗體譜系特征 。 相對之前的免疫背景 ， BA.5突破感染者的主要中和抗體類別相對單一 ， 非中和抗體比例提高 ， 更容易滋生病毒變異去逃逸宿主免疫；5）利用高通量酵母展示技術精準繪制出抗體免疫逃逸圖譜 ， 與BA.2突破感染的免疫背景相比 ， BA.5突破感染中和抗體的免疫逃逸位點相對集中且大多出現在近期出現的突變株上 。 實驗數據與真實世界監測結果高度一致 。 這一研究成果能夠實現對未來一段時間內新突變株的精準預測 ， 預先了解這些新突變株的病毒特性能夠為科學精準防控留出寶貴的時間窗口 。