代謝|觀察|當質譜技術結合人體代謝物,泛癌篩查還有哪些挑戰?( 五 )


合肥隊列包括175人 , 其中包括30名健康對照組和145名I-IV期癌癥患者:肝癌(n = 29)、肺癌(n = 28)、結直腸癌(n = 30)、胃癌(n = 30)、甲狀腺癌(n = 28) , 作為該研究的外部驗證隊列進行進一步調查 。 遺憾的是 , 在合肥隊列中缺乏胰腺癌的病例 。
結果顯示 , 在內部驗證隊列中 , MNALCI表現出了93%的靈敏度和91%的特異性;在外部驗證隊列中表現出了84%的靈敏度和84%的特異性 。 此外 , 在上述6種癌癥中 , 識別腫瘤組織的總體準確性在內部驗證隊列中為92% , 在外部驗證中為85% 。
研究團隊發現了多達8個代謝物生物標志物 。 即2-氧代戊酸、組胺、葡萄糖、5-羥甲基尿嘧啶、2-糠酸、甲基丙二酸、4-甲基兒茶酚和L-肉堿 , 這些代謝物中 , 有大部分在其他地方被報道過與癌癥有關系 。
研究團隊在論文中強調 , 需要注意的是 , MNALCI方法并非要取代其它液體活檢方法 。 相反 , 這種方法可與如mRNA、miRNA、突變的或5-羥甲基化的cfDNA、循環蛋白等其它生物標志物篩選策略相結合 。 他們還指出 , MNALCI方法并不能區分NSCLC、CRC和PTC中常見的致病性突變 。 然而 , 基于cfDNA突變的液體活檢在很大程度上依賴于驅動基因的突變 , 對于具有陰性驅動基因突變的癌癥(占癌癥中的很大一部分)來說 , 其靈敏度可能會受影響 。
代謝|觀察|當質譜技術結合人體代謝物,泛癌篩查還有哪些挑戰?
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MNALCI與血清腫瘤抗原診斷特異性腫瘤的比較 。
研究團隊認為 , 多種液體活檢策略的結合可以提供額外的信息 , 進一步提高癌癥診斷和識別腫瘤組織來源的準確性 。
鄭杰也對澎湃新聞采訪人員表示 , 多組學是未來的一個大趨勢 。 “代謝物是信號通路的終端產物 , 代謝物的信息和最終的表型更為接近 , 更利于癌癥的分型和標志物的發現 , 但我們也認為臨床患者的真實情況應該是從生命多個維度去反映的 , 所以我們也正在去從多組學這個方向去探索一些癌癥的研究 , 會結合基因組、代謝組、影像組等 , 融合 。 ”
鐘晟則強調一點 , 腫瘤檢測其實有非常細分的場景:“腫瘤的普篩(或叫腫瘤初篩) , 到高危人群的精篩 , 再到疑似腫瘤患者的早期診斷 , 再到臨床金標準診斷 , 至少可以分為4個階段或4個場景去做產品的設計和迭代 。 ”
而他認為 , 從當前的技術來看 , “這十幾年里很難做到一種技術能夠同時解決篩查和診斷的問題 。 ”
“我們的真實的感受是 , 針對不同場景 , 我們從樣本的采集、樣本的處理到建庫 , 再到算法 , 直至最后模型 , 這些都是不一樣的 。 ”鄭杰也類似提及 , “而無論是質譜技術 , 還有影像分析技術或是基因組技術 , 通過不同技術的搭配 , 然后再結合樣本的采集處理 , 還有和算法相互結合 , 我們會有不同的方案去針對不同的場景解決癌癥的這樣一個大的話題 。 ”
研究團隊在論文中還總結提到 , 這行研究為實現高性價比和高通量的多癌種篩查技術奠定了概念和實踐基礎 。 “在不遠的未來 , 該方法的檢測成本預估可低于100美元 , 一個設備齊全的實驗室每天可分析超過3000個樣本 。 ”
論文鏈接:https://www.nature.com/articles/s41467-021-26642-9