其次，“細胞因子風暴”，細胞因子如TNF-α、IL-1等是指免疫系統用來發出警報的蛋白質，它們負責把免疫系統集中到感染部位 。接著，免疫細胞殺死被感染的組織，挽救身體其他部分 。免疫系統的日常工作是清除感染，當人體碰到威脅時依賴免疫系統保護自己 。“細胞因子風暴” （cytokine storm）是指是指機體感染微生物后引起體液中多種細胞因子迅速大量產生的現象，假如免疫系統被激活到極限程度或者失去控制，它就會傷害宿主，極端的免疫攻擊，引起肺部嚴峻損傷，導致急性呼吸衰竭和多臟器衰竭 。除了肺部病變特征以外，出現了至少一種其他癥狀：肝酶升高，白細胞和血小板數量減少，血壓降低、急性腎損傷、心肌損害、心臟驟停，即免疫系統不僅攻擊被感染的細胞，連健康組織也不放過 。
最后是多器官功能損害，產生細胞因子風暴后，由于引發的炎癥導致的細胞因子風暴會進入循環系統，引發多個器官的系統性問題，出現腎功能衰竭、心肌損害、心力衰竭、肝功能損害、凝血功能障礙 。
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