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疫情|又是德爾塔！湖南疾控最新通報！

自7月28日拿到湖南省2021年第一例本土新冠肺炎病例標本以來 ， 目前湖南省疾控中心已完成20例新冠病毒基因組測序 ， 已經完成測序結果的20個標本均為德爾塔毒株 ， 與南京高度同源 。 湖南省疾控中心提醒 ， 廣大民眾一定不能掉以輕心 ， 嚴格執行好持碼（健康碼、行程卡）進出、測量體溫、佩戴口罩、保持距離等措施 ， 減少不必要的人員聚集 ， 有效降低病毒傳播風險 。
【疫情|又是德爾塔！湖南疾控最新通報！】5天時間完成20例標本測序
據湖南省疾控中心檢驗科科長湛志飛介紹 ， 基因組測序可在第一時間獲取新發未知病毒的基因組序列信息 ， 已成為研究疾病暴發的重要工具 。 通過構建進化樹 ， 研究不同患者病毒遺傳序列變化 ， 能在分子生物學層面揭示病毒的傳播方式 ， 分析新冠病毒的進化來源 ， 研究新冠病毒的致病病理機制 ， 為控制疫情暴發提供科學依據 。
通過檢測新冠病毒的全基因組序列 ， 再將這個序列通過算法與數據庫中的數據進行比對 ， 可以初步判斷其地域來源 。 將序列與既往病例序列進行比對 ， 如果序列在同一進化樹分支上 ， 則可以判斷這些病例是否來自同一傳播鏈或傳染源 。
面對此次疫情 ， 從7月28日拿到湖南省2021年第一例本土新冠肺炎病例標本以來 ， 湖南省疾控中心已完成20例標本測序 。
24小時完成病毒基因測序溯源
“新冠病毒樣本送到實驗室后 ， 一般需要經過多個步驟完成檢測 。 ”湛志飛表示 ， 接到陽性樣本后 ， 工作人員首先進行復核工作 ， 對樣本進行核酸提取 ， 再用兩種試劑進行核酸檢測 。 復核陽性的標本 ， 分別用二代和三代高通量測序技術進行序列測定 ， 為病毒溯源工作設置“雙保險” ， 確保萬無一失 。
病毒基因序列測定完成后 ， 工作人員還要馬上進行生物信息學分析 ， 將病毒序列與數據庫中的序列進行比對 ， 查看有無變異位點 ， 進行同源性比較 。 完成數據比對后 ， 工作人員還要及時撰寫溯源報告 。
“目前 ， 湖南省疾控中心已具備新冠病毒基因組高通量二代和三代測序能力 ， 為湖南省新型冠狀病毒疫情以及其他傳染病病原體的鑒定和溯源、防控應對提供了強大的技術支撐 。 ”湛志飛介紹 ， 目前湖南省疾控中心培養了3名技術骨干 ， 所有的新冠病毒基因組測序都能在24小時內完成 ， 情況復雜的也不會超過48小時 。
測序結果與南京高度同源
7月28日 ， 接到2021年第一例本土新冠肺炎病例標本測序工作以來 ， 湖南省疾控中心立即組織專業技術人員 ， 日夜不停地開展測序工作 ， 通過文庫制備、簇生成、上機測序與數據比對分析 ， 已經完成測序結果的標本均為德爾塔毒株 。 從國家疾控中心反饋的結果顯示 ， 和江蘇省報送的南京疫情本土病例新冠病毒基因組序列高度同源 。
來源：長沙晚報
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