細胞分化的實質是基因選擇性表達 。從分子水平看，細胞分化意味著各種細胞內合成了不同的專一蛋白質，而專一蛋白質的合成是通過細胞內一定基因在一定的時期的選擇性表達實現的 。因此，基因調控是細胞分化的核心問題 。
【細胞分化的實質是】細胞分化是指同一來源的細胞逐漸產生出形態結構、功能特征各不相同的細胞類群的過程，其結果是在空間上細胞產生差異，在時間上同一細胞與其從前的狀態有所不同 。細胞分化的本質是基因組在時間和空間上的選擇性表達，通過不同基因表達的開啟或關閉，最終產生標志性蛋白質 。一般情況下，細胞分化過程是不可逆的 。然

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