環狀RNA(circRNA)是一種新興的內源性非編碼RNA(ncRNA) , 它們參與細胞增殖、粘附、凋亡和存活等多個生物學過程[1] 。
近年來 , circRNAs在腫瘤領域也獲得了越來越多的關注 。 有研究表明許多circRNA能促進細胞周期發展 , 抑制或誘導腫瘤細胞凋亡以及抑制血管生成等等[2] , 各種不同的circRNAs在腫瘤發生發展過程中起著不同甚至相反的作用 。
雖然越來越多的研究報道了乳腺癌、肺癌和結直腸癌中異常的circRNAs[3] , 但circRNAs在腫瘤細胞中的生物學功能、分子機制和環狀模式尚不清楚 。 此外 , 還有研究提出circRNAs可以通過病理功能未知的外泌體分泌到循環中[4] , 且比線性RNAs更容易被分選進入外泌體 。 然而 , circRNAs的外泌體特異性分選機制也仍然完全未知 。
近日 , 來自浙江大學張紅河和中國藥科大學來茂德領銜的研究團隊 , 闡明了circRHOBTB3在結直腸癌(CRC)進展中的生物學作用、環化過程和分泌途徑 , 這一結果發表在MolecularCancer期刊上 。
他們發現 , 抑瘤circRHOBTB3通過外泌體被癌細胞排出 , 以維持結直腸癌細胞的活性 。 此外 , 他們還設計了靶向circRHOBTB3的環狀化和分泌元件的反義寡核苷酸(ASOs) , 用于CRC的治療 。

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論文首頁截圖
circRHOBTB3是宿主基因RHOBTB3轉錄后剪接和環狀化而產生的一種circRNA 。 RHOBTB3作為RhoGTPase家族ATP酶 , 參與膜轉運[5、6]和蛋白酶體降解[7] 。
先前的研究也表明circRHOBTB3在CRC、卵巢癌、胃癌和肝細胞癌(HCC)中作為腫瘤抑制circRNA 。 然而 , 它的循環模式和外泌體分泌途徑并未被闡釋 。
首先 , 研究人員分析了來自GEO數據庫的12例CRC患者、21例HCC患者、32例胰腺腺癌(PAAD)患者和14例健康供體的血清外泌體的總RNA-seq數據 。
結果顯示 , 許多circRNAs在腫瘤患者血清外泌體中的表達程度不同(圖1A) , 但在所有三種癌癥來源的外泌體中 , 只有hsa_circ_0007444(circRHOBTB3)均表達上調(圖1B) , 且其宿主基因RHOBTB3在三種腫瘤組織中的表達與正常組織相比均無顯著性的增強(圖1C) 。

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圖1不同類型癌癥中ircRHOBTB3在患者血清外泌體中的表達情況
然而 , 對來自浙江大學醫學院邵逸夫醫院體檢的18例CRC患者和16例健康供者的血清樣本數據分析發現 , 與健康供者相比 , circRHOBTB3在CRC組織中顯著下調 , 而宿主基因RHOBTB3顯著上調(圖2左二) 。 而且 , 在69個CRC組織樣本中檢測到的circRHOBTB3的表達結果顯示 , circRHOBTB3水平較高患者的總生存期更好(圖2右一) 。
圖2ircRHOBTB3在CRC組織中患者血清外泌體中的表達情況
于是 , 研究者不禁假設 , circRHOBTB3是否具有抑癌作用?
為了驗證這一點 , 他們先確定了CRC患者血清外泌體中的circRHOBTB3確實來源于腫瘤細胞而非基質細胞(圖3A) , 且circRHOBTB3水平在來自NCM460細胞(正常的腸上皮細胞系)的外泌體中最低(圖3B) 。 進一步在RKO、HCT116細胞(CRC細胞系)中過表達或敲低circRHOBTB3 , 結果表明circRHOBTB3可以抑制細胞遷移和侵襲能力(圖3C) 。

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圖3circRHOBTB3來源與功能的體外驗證實驗
并且 , 他們通過對circRHOBTB3敲除/重新表達細胞系RNA-Seq數據的分析 , 以及RT-qPCR驗證發現 , 在circRHOBTB3敲除的細胞系中代謝、增殖和上皮間充質轉化(EMT)通路相關基因顯著上調 , 而circRHOBTB3的重新表達降低了這些基因的表達 。 此外 , circRHOBTB3敲除的細胞系中ROS水平也顯著升高 。
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