德爾塔奧密克|最早發現于法國的德爾塔奧密克戎重組變異如何？巴斯德研究所詳解( 二 ) 重組|病例|異體|研究人員|譜系

這項研究中的法國所有XD病例都是有癥狀的，大多數報告的癥狀是頭痛（61.1%），虛弱/疲勞（58.3%），咳嗽（44.4%），發燒（38.9%）和肌痛（33.3%）。 2例XD病例住院治療，其中1例原因不明，但時間少于24小時，沒有重癥監護入院。
研究指出，目前報告的所有XD病毒都可能來自一個獨特的祖先。他們分離出每個親本譜系的代表性病毒，以及重組XD病毒，從而進一步證明了重組基因型。他們提到， 2021年12月27日在Ile-de-France采樣的AY.4病毒與XD變異體德爾塔樣區域具有100%的一致性， BA.1病毒與XD變異體的奧密克戎樣區域具有100%的一致性。
在感染小鼠中表現不同于奧密克戎
與SARS-CoV-2原始毒株序列相比，奧密克戎的刺突蛋白上積累了廣泛的突變。由于XD刺突蛋白攜帶BA.1的大部分特征變化，包括整個受體結合域(RBD) ，研究人員假設這一重組變異體可能具有相似的免疫逃逸特性。

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XD重組和免疫逃逸。
通過測試病毒對疫苗接種者血清的敏感性發現，與原始病毒相比，研究觀察到血清對德爾塔的中和滴度僅小幅降低。相比之下， XD重組變異體和 BA.1在2劑疫苗后1個月或6個月的血清樣本中幾乎都沒有中和。在第三劑免疫后1個月，滴度都高得多，不過與原始病毒相比，它們對 BA.1和XD的中和效率仍然降低8倍至10 倍。
【德爾塔奧密克|最早發現于法國的德爾塔奧密克戎重組變異如何？巴斯德研究所詳解】研究團隊認為，這些結果表明XD變異體顯示出與BA.1相似的免疫逃逸特性，并進一步強化了刺突蛋白RBD表位在血清組中疫苗誘導的中和反應中的主要作用。
值得關注的是，與德爾塔相比，奧密克戎BA.1與較低的嚴重疾病風險相關。一致地， BA.1已被證明在嚙齒動物模型中引起減毒疾病，包括在人ACE2 轉基因 (K18-hACE2) 小鼠的高度敏感模型中。
研究團隊對K18-hACE2 小鼠進行攻毒試驗后發現，感染后3天 (dpi) 時，感染 BA.1或XD病毒的小鼠肺部病毒RNA水平相當，比感染AY.4的動物低3.7倍。相比之下， XD 感染小鼠鼻甲中的病毒載量比 BA.1 感染動物高8.5倍，僅略低于AY.4感染小鼠。在測量傳染性滴度時注意到了類似的差異。
他們還在11天內監測了小鼠的體重減輕和疾病。與主要的德爾塔譜系一樣， AY.4分離株導致體重減輕的疾病在感染后3天時加速， 7只小鼠中有6只在感染后7-9天時達到人道終點。 BA.1感染則與體重無關。對于XD 病毒，研究人員在感染后5天內的這一期間沒有觀察到體重減輕，但所有小鼠在第5天和第8天之間迅速惡化，并在第 9天死亡或不得不實施安樂死。
研究團隊總結稱，總之，這些結果表明德爾塔-奧密克戎XD重組變異體在K18-hACE2小鼠中有著不同于奧密克戎BA.1的臨床特征。這進一步表明，該模型中 BA.1 的減毒表型不能僅視為與刺突蛋白的變化有關，需要進一步的實驗來確定小鼠感染XD后表型的基礎，并確定這與人類XD感染的關系。

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XD（綠）與德爾塔AY.4（藍）、奧密克戎BA.1（黃）在K18-hACE2小鼠的表型差異。
研究團隊還進一步研究了XD病毒復制適應性的潛在差異。他們以 1:1、1:9 或 9:1 的比例為K18-hACE2小鼠組接種了BA.1和XD病毒的混合物，并使用宏基因組測序來估計肺和鼻甲中病毒基因組在感染后3天時的比率。結果顯示，雖然BA.1在肺中始終勝過XD重組變異體體，但在鼻甲中觀察到相反的情況。