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療法|糞菌移植太粗放，精準調菌有5招( 二 )

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他的團隊對晚期黑色素瘤患者的腸道微生物組也進行了分析 ， 此次分析使用了 Microbiotica 公司自己研發的基因組測序方法 。 結果顯示 ， 有 9 種細菌富集于對免疫療法有響應的患者體內[7] 。 更為重要的是 ， 使用這些細菌在四個獨立隊列中預測患者反應的準確率高達 91% 。
Robinson 說：“這些細菌的豐富程度似乎對患者是否有免疫反應有很大影響 。 ”
Robinson 認為 ， 服用由 9 種細菌組成的細菌聯合體 MB097 ， 將會使無反應患者更有可能從抗 PD-1 治療中獲益 。 而且 ， 與已顯示出治療希望的基于 FMT 的方法相比[8-9] ， 使用MB097可能更具針對性和有效性 。
Robinson 宣稱 ， 與在短時間內有效的 FMT 療法不同 ， MB097 可以通過每天給藥 ， 將有益細菌長期維持在高濃度水平 。 他的團隊計劃在 2023 年進行一項臨床I期試驗 ， 將 MB097 與抗 PD-1 聯用 ， 用于治療六個月內免疫治療無效的晚期黑色素瘤患者 。
Robinson 說 ， 對于這些患者 ， “我們希望能夠改變他們疾病的發展軌跡” 。
療法|糞菌移植太粗放，精準調菌有5招
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招數3:CRISPR基因編輯技術 其他研究團隊則傾向于避免可能破壞腸道微生物組微妙平衡的行為 ， 包括引入或去除細菌群落 。
總部位于巴黎的 Eligo Bioscience 公司對更溫和的方法感興趣 。 該公司專門從事基因治療方法的研究 ， 通過工程噬菌體衣殼向腸道微生物提供 DNA 有效載荷 。 當具有治療作用的 DNA 有效載荷到達靶標 ， 它們會使有害基因失效或使治療相關蛋白質得以表達 。
該公司的主要研發項目是 EB003 。 這是一種噬菌體衍生的納米顆粒 ， 經過工程設計 ， 可附著在表達志賀毒素的腸出血性大腸桿菌 O157:H7 上 。 這種大腸桿菌表達的毒素會破壞腸道內壁 ， 導致血性腹瀉 。 5 歲以下的兒童尤其容易遭受這種感染 ， 高達 15% 的患者會發展為可能危及生命的溶血性尿毒癥綜合征[10] 。
當工程化納米顆粒接觸到腸出血性大腸桿菌 O157:H7 后 ， 其會輸送一批編碼 CRISPR-Cas 核酸酶的 DNA 和相應的引導 RNA ， 使兩個表達志賀毒素的基因失效 ， 從而殺死該細菌 。
EB003 在經表達志賀毒素的大腸桿菌感染的兔子模型中進行了測試 。 接受了 EB003 治療的兔子的感染持續時間明顯短于接受緩沖液治療的對照組 。
Eligo Bioscience 首席科學官 Edith Hessel 博士解釋說：“EB003 可以緩解腹瀉的癥狀 ， 顯著加快上皮細胞的恢復速度 ， 并阻止毒素的釋放 。 ”
在 Hessel 博士看來 ， EB003 展示了選擇性改變微生物群的優勢 。 她解釋說：“你不僅想殺死（有害的）細菌 ， 你還要以一種非常特殊的方式殺死它 ， 以保持其他大腸桿菌完好無損 。 ”
招數4:“操控”微生物組的活性 Enterome 公司正在采用類似的更加溫和的方法來改變腸道微生物組 。 這家總部位于巴黎的公司的一個團隊正在專注于尋找腸道細菌分泌的小蛋白 ， 這些蛋白與人類細胞因子或激素一樣 ， 可以影響腸道和其他地方的生理過程 。
Enterome 公司的一個項目與潰瘍性結腸炎有關 ， 這是一種發生在結腸和直腸內壁的炎癥 。 為了推進這項計劃 ， 該公司的科學家決定尋找能夠自然誘導腸道免疫細胞分泌白細胞介素 -10 的蛋白質 。 白細胞介素 -10 是一種有效的免疫調節細胞因子 ， 具有抑制炎癥的作用 。
該公司擁有一個“腸道細菌分泌小蛋白”數據庫 ， 這一數據庫包含了約 2 萬個來自數千人的腸道微生物組的小蛋白數據 。 Enterome 公司的科學事務經理 Grégoire Chevalier 博士解釋說：“該數據庫可以用來篩選出能夠在體外誘導人類單核細胞分泌白細胞介素 -10 的蛋白質 。 ”