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病毒|上海疾控為“德爾塔”查“家譜”，“病毒手鏈”有多長？

8月4日上海市召開疫情防控新聞發布會表示 ， 目前 ， 上海市疾控中心完成2日發現的上海浦東機場貨運區一名外航貨機服務人員確診病例的流行病學調查和基因測序工作 。
基因測序結果顯示 ， 上海的這名病例感染的新冠病毒屬于德爾塔變異株 。 經比對 ， 與近期國內多地本土病例檢出的病毒基因組同源性低 ， 但與境外“德爾塔”變異株同源性較高 。
都是“德爾塔”
為何判斷上海病例感染病毒
來自國外而非國內？
上海市疾控中心昨天做出了詳細解釋！
全基因組測序：
解密“病毒手鏈”
新冠病毒就像一條手鏈 ， 可以由不同的珠子串起來 ， 手鏈上的每顆珠子都是具有特殊功能的基因 。

病毒|上海疾控為“德爾塔”查“家譜”，“病毒手鏈”有多長？
文章圖片

當把珠子放大 ， 就會發現每顆珠子都是由四種堿基緊密排列組成的 。 所以 ， 基因測序就是先發現珠子 ， 再放大看其中的堿基是怎么排列的；當把堿基排列情況看清楚時 ， 就可以完全測定出來新冠病毒的核酸序列 。
新冠病毒這條“手鏈”的長度為29903（約3萬）個堿基 。

病毒|上海疾控為“德爾塔”查“家譜”，“病毒手鏈”有多長？
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在以前技術不是那么發達的時候 ， 技術人員測定整個基因組可能要耗費數周甚至數月的時間 。 隨著科學技術的發展 ， 憑借全基因組測序技術 ， 可以一次性完成之前數月的工作 。
測定出新冠病毒的序列后 ， 就可以分型了 。
還是拿手鏈打比方 ， 通過對比不同“手鏈”的差異 ， 我們可以將相似的“鏈子”歸到同一個“系列” ， 這個過程叫分型 。
各種分型方法的原理是類似的 ， 都是利用病毒傳播過程中核酸序列上特定位置的變化來進行分型 ， 這對防控工作十分重要 ， 是明確病毒來源并調整防控策略的重要依據之一 。
為什么能通過基因測序鎖定病毒來源？
上海市疾控中心對上海市8月2日病例的呼吸道標本開展了新冠病毒全基因組序列測定 。
結果顯示 ， 雖然該病毒屬于德爾塔型 ， 但它的變異情況和一株北美株高度相似 ， 而與近期我國其他地區的病例感染的病毒變異不一樣 。 結合病例的工作性質 ， 因此推測此次本土病例感染來源很可能是國外而不是國內其他地區 。
病毒發生變異后 ， 這些變異會遺傳給病毒的下一代并且不大可能返祖 ， 也就是說處在同一傳播鏈條上的病例帶有的病毒肯定會包含之前傳播者帶有的病毒的全部變異 。 因此 ， 通過比較病毒變異是否一致 ， 我們就可以判斷兩個病例之間是不是在同一傳播鏈上 ， 一例一例比較后能精準地推斷病毒的來源 。
基因測序還有哪些高大上的作用？
科學家通過對病毒進行全基因組測序 ， 可以了解新冠病毒不同傳播階段的變異情況 ， 由此推測病毒對人的感染力的變化情況 。
基因測序還可以了解現在的核酸檢測診斷試劑是否有效 ， 因為核酸檢測僅僅是檢測病毒核酸序列的一部分 ， 如果被檢測的這部分序列發生改變 ， 那么就需要對檢測試劑進行改進了 。
另外 ， 疫苗研發者可利用基因組測序技術觀察病毒變化情況 ， 研究現有疫苗或正在研發的疫苗是否有效 ， 從而對疫苗的研發策略進行修改 ， 讓疫苗更有針對性 。
本文素材來源于上海疾控、上觀新聞等
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