作者:百趣代謝組學

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發表期刊:NatureCommunications
影響因子:12.353
發表時間:2019年
合作單位:第三軍醫大學附屬西南醫院
今天百趣代謝組學將給大家分享NatureCommunications上的一篇文章:ABHD5bluntsthesensitivityofcolorectalcancertofluorouracilviapromotingautophagicuracilyield 。
百趣代謝組學分享 , 氟尿嘧啶(Fu)是最常用的治療直腸癌(CRC)的藥物 。 然而因藥物抗性 , 極大限制了其治療的療效 。 自噬(macroautophagy)是一種細胞分解代謝過程 , 自噬有潛力為附近所有代謝途徑供能 , 為細胞提供巨大的代謝可塑性 。 代謝重編程和代謝酶的異?;钴S被認為是惡性腫瘤的特征之一 。
作者證明ABHD5定位于溶酶體后與PDIA5相互作用 , 防止PDIA5與RNASET2相互作用 , 從而使RNASET2失活 。 代謝組學分享 , 它會損害RNASET2介導的自噬尿嘧啶產量 , 促進結直腸癌細胞將FU作為外源尿嘧啶攝入 , 從而增加其對FU的敏感性 。 研究結果首次揭示了ABHD5在調節溶酶體功能中的新作用 , 對基于FU輔助化療后的機體恢復提供了重要見解 。
ABHD5降低了CRC細胞對FU的敏感性

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圖1ABHD5降低了CRC細胞對FU的敏感性
采用癌癥藥物敏感性基因組學數據集 , 將ABHD5表達水平與化療結果相關的敏感性數據集集合起來 , 通過Pearson’scorrelations的分析方法 , ABHD5表達在pMMR和dMMRCRC細胞系中都和IC50呈現正相關(圖1a) 。 代謝組學分享 , 相比較與正常的癌細胞 , ABHD5基因敲除的細胞(ABHD5KD)在FU處理下IC50 , 細胞活力顯著降低(圖1b-c) , 細胞凋亡率顯著升高(圖1d) 。
隨后作者做了小鼠實驗 , 通過生物發光成像和TUNEL染色 , 得到同樣的結論 , ABHD5KD組小鼠對FU處理后腫瘤負荷明顯減小(圖e) , 并且組織中腫瘤細胞凋亡率增加(圖f) 。 代謝組學分享 , 對不同的小鼠做ABHD5基因敲入和敲除后 , 用PBS或FU處理 , 每隔一段時間給小鼠和腫瘤組織稱重 , 發現ABHD5KD+FU處理組明顯病情得到緩解(圖1g-h) 。 再通過Caspase-3對凋亡細胞或Ki67對增殖細胞做免疫組化檢測 , 也得到相同的結論ABHM5KD+FU處理明顯抑制了細胞的增值并表現較強的敏感性(圖1i-j) 。
FU輔助的化療效果受ABHD5表達量影響

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圖2ABHD5的表達以及FU輔助化療的療效
將NCBI-GEO數據集中361名CRCs患者分為ABHD5high組(262例)和ABHD5low組(99例) , 統計結果顯示ABHD5high可能是BRAF陽性突變(BRAFMT) , p53野生型(p53WT)和染色體不穩定陰性型(CIN-)(圖2a-b) 。 只用FU治療的ABHD5high效果較好 , 有化療的還是ABHD5low組更好(圖2c-d) 。 代謝組學分享 , 用另外一組大數據量進行驗證 , 也是同樣的結果 , ABHD5low組更適合FU+化療(圖e-f) 。
ABHD5通過提高自噬性
尿嘧啶的產量來控制FU的攝取

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圖3ABHD5影響CRC細胞對FU的攝取
通過HPLC發現ABHD5KD細胞中FU濃度增加 , WB顯示PBS或者FU處理的正常癌癥細胞中都沒有發現TS,TP,DPD(這3個酶控制FU代謝)的變化 , 可能是FU濃度和藥物吸收能力相關(圖3a-b) 。 代謝組學分享 , 但是FU處理后 , ABHD5KD細胞尿嘧啶減少(圖3c) , 但是尿嘧啶生物合成限速酶CPSII和UMPS沒有發生變化(圖3d) 。 ABHD5可能通過其他的方式影響了尿嘧啶的產量 。
在GSE38832數據集122例CRCs , ABHD5low組溶酶體途徑相關基因是下降的(圖3e) , 根據數據做了個熱圖 , 猜想溶酶體RNA的降解使得細胞產生了自噬 , 從而提高了尿嘧啶的含量(圖3f) 。 HCS分析顯示自噬體的量和FU的含量呈現負相關趨勢(圖3g-h) 。 代謝組學分享 , ABHD5過表達的細胞在FU和靶向藥物處理后 , 才使得胞內尿嘧啶和FU的濃度提高(圖3i-j) 。 在PDX模型中BECN1激活劑對ABHD5KD中的尿嘧啶和FU的濃度影響不是很大(圖3k-l),說明ABHD5通過其他途徑調節細胞自噬 。
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