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1. microRNA：microRNA最早于1993年由Lee等人在線蟲（G.elegans）體內發現 ， 由20～25個核苷酸組成 ， 通過與靶mRNA的結合 ， 調節靶蛋白的表達 ， 參與調節腫瘤的發生和發展 ， 具有組織特異性、腫瘤特異性、可由外泌體途徑分泌入血及穩定性強等特點 。 國外有學者曾經對肝癌和癌旁組織及12例正常肝組織中應用RT-PCR對182個microRNA前體進行篩查研究 ， 發現在肝癌中存在microRNA的顯著性表達 。 多項研究認為 ， microRNAs表達譜在肝癌的早期診斷和慢性肝病的分子分型方面具有廣闊的應用前景 。 microRNA作為一種新的腫瘤標志物已逐步引起臨床重視 。 microRNAs表達譜進行不同組合檢測 ， 可提高對HCC的診斷靈敏性和特異性 。
2. cfDNA：cfDNA是血液循環中的細胞外DNA片段 ， 長度約為166bp ， 主要來自機體細胞的主動或被動裂解 ， 攜帶有機體細胞來源的遺傳信息 。 研究證明癌癥患者的cf DNA中會出現腫瘤相關的變異特征 ， 通過檢測血漿中cf DNA癌癥及早期標志物 ， 可極早期預警癌癥風險 。 Tokuhisa等研究發現 ， 丙肝相關HCC患者血清cfDNA含量（115 ± 98.3）ng/ml顯著高于單純丙肝病毒感染者（34.40 ± 40.4）ng/ml 。 Hosny等研究顯示 ， 乙肝相關HCC患者 ， 血清 cfDNA含量顯著高于乙肝肝硬化患者和健康人群 ， 分別為（899 ± 2185）ng/ml、（95 ± 238）ng/ml和（45 ± 54）ng/ml 。
3. ctDNA：來源于腫瘤細胞的cfDNA被稱為ctDNA 。 對ctDNA的定量及定性檢測 ， 能夠精確的、實時的了解腫瘤的生物學特性 ， 用于腫瘤診斷、藥物治療、療效評估、復發監測及預后預測 ， 在腫瘤精準醫療中具有重要價值 。 有學者對16篇文獻進行薈萃分析 ， 共納入患者3744例 ， 其中1852例為HCV-HCC ， 1892例為無HCC的HBV感染者 。 結果顯示ctDNA對HBV-HCC診斷的匯總敏感性、特異性和診斷OR分別為0.85 ［95%CI為（0.78 ， 0.90）］、0.74 ［95%CI為（0.63 ， 0.83）］ 和15.98 ［95%CI為（10.65 ， 23.99）］ 。 研究認為 ，ctDNA檢測對HCC的診斷具有較高的敏感性、特異性和準確率 ， 可以作為HBV相關HCC早期診斷中有希望的循環生物標志物 。
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