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單基因分析+簡單實驗，就可以發表6分+

健康知識養生常識

作者：作圖丫
導語
EEF1E1在卵巢癌、乳腺癌、非小細胞肺癌和其他癌癥中發揮作用 ， 但其在肝細胞癌（HCC）中的作用和機制尚不清楚 。
背景介紹
今年小編為大家帶來一篇單基因腫瘤分析發表了6分+的文章 ， 讓我們一起看看有什么與眾不同之處吧！文章題目為ANovelHCCPrognosisPredictorEEF1E1IsRelatedtoImmuneInfiltrationandMayBeInvolvedinEEF1E1/ATM/p53Signaling 。
單基因分析+簡單實驗，就可以發表6分+
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數據介紹
來自TCGA、ICGC、CPTAC的公共數據庫 。
研究設計
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結果解析
01EEF1E1的差異表達
MannWhitneyU檢驗顯示 ， EEF1E1在腫瘤中的表達高于正常水平 ， 差異有統計學意義（P<0.001）（圖1A） 。 t檢驗顯示腫瘤高于正常水平的平均水平 ， 差異有統計學意義（t=7.572 ， P<0.001）（圖1B） 。
為了確認EEF1E1的表達模式和臨床意義 ， 從國際癌癥基因組聯盟（ICGC）數據庫（https://dcc.icgc.org/）項目中檢索并獲得了肝細胞癌隊列（包括202個正常對照和243個腫瘤標本）的基因表達譜 。 Kaplan-Meier分析表明 ， EEF1E1在癌癥中的表達水平顯著高于正常水平 。
為了確定兩組（癌癥和正常 ， 癌癥和癌旁）之間EEF1E1蛋白表達的差異 ， 根據臨床蛋白質組學腫瘤分析聯盟（CpTAC）（https://cptac-data-portal.georgetown.edu/datasets）的標準化數據分析了330例肝細胞癌和副組織 。 結果表明 ， EEF1E1蛋白在癌組織中的表達顯著高于對照 。 同EEF1E1蛋白在癌組織中的表達顯著高于鄰近組織中的表達（圖1C） 。
為了進一步驗證EEF1E1表達的結果 ， 收集了22例含有癌癥和癌旁癌的HCC樣本 ， 并通過免疫組化檢測EEF1E1表達 。 EEF1E1在HCC細胞的細胞核和細胞質中均有表達 ， 但主要在細胞質中表達 。 同時 ， 癌癥中的EEF1E1蛋白水平明顯高于癌旁 。
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圖1
02EEF1E1表達與臨床特征
EEF1E1的表達與肝癌患者體重呈正相關 。 MannWhitneyU檢驗顯示 ， 體重>70患者EEF1E1表達水平低于體重<70患者 。
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圖2
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圖3
EEF1E1表達水平與AFP水平顯著相關 。 在組織學分級中 ， G1EEF1E1的表達與G3和G4的表達差異有統計學意義 ， G2EEF1E1的表達與G3的表達差異有統計學意義 。 在T期 ， EEF1E1在T1中的表達與T2和T3的表達有顯著差異 ， 但與其他階段無顯著差異 。 EEF1E1表達與M期和N期無關 。 EEF1E1在I期的表達與II期和III期的表達有顯著差異 。
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圖4
以上結果表明 ， EEF1E1的表達水平與體重、BMI、腫瘤狀態、血管浸潤、AFP、物流分級、T分期和病理分期有關（圖2-5） 。
03EEF1E1是肝癌的獨立預后指標
KaplanMeier生存分析用于評估EEF1E1mRNA和蛋白表達在肝癌患者預后中的價值 。 結果顯示 ， EEF1E1的表達與肝癌患者的預后相關 。 與EEF1E1低表達患者相比 ， EEF1E1高表達患者的預后較差 ， 無論是總生存期、疾病特異性生存期還是無進展生存期（圖3） 。
EEF1E1表達水平對肝癌患者預后的影響也與年齡、體重、性別、種族、BMI、AFP、血管浸潤、M0、N0 。 此外 ， EEF1E1表達水平對肝癌患者預后的影響也與T分期、病理分期、組織學分級等有關（圖4） 。
作者使用單變量Cox回歸分析評估了與OS相關的變量 。 單因素Cox模型顯示 ， 高EEF1E1表達與OS較差密切相關 ， T分期、病理分期、組織學分級也是如此 。 多因素Cox回歸顯示 ， 高EEF1E1表達是與OS相關的唯一獨立預后因素 。