北京大學第三醫院(以下簡稱“北醫三院”)圍繞科技創新工作 , 通過平臺搭建、資源配置、經費支持等多方面 , 為全院開展創新工作搭建了廣闊的舞臺 , 創造了科技發展新生態 。 各研究團隊積極探索 , 創新能力明顯提升 , 各研究團隊取得了多項科研成果 。
本期向大家介紹3篇在國際高水平期刊上發表的成果 。
毛鳳彪研究員/喬杰院士團隊建立首個實現eccDNA數據整合和表觀遺傳調控預測的分析平臺
2022年1月7日 , 北醫三院毛鳳彪研究員/喬杰院士團隊和中科院北京基因組研究所李明錕團隊合作在Biochemistry & Molecular biology(生物化學與分子生物學)領域排名第八的 Nucleic Acids Research 數據庫專刊上發表了“CircleBase: an integrated resource and analysis platform for human eccDNAs”的論著 ,建立了預測染色體外環狀DNA(eccDNA)在表觀遺傳層面調控基因表達功能的數據庫平臺CircleBase , 通過結合測序數據集、計算預測和手工注釋等 , 對目前公開發表的60多萬個eccDNA表觀遺傳調控潛能完成了系統的梳理和預測 。
隨著高通量測序技術的快速發展 , 人類基因組中發現了成千上萬個染色體外環狀 DNA(eccDNA) 。 因為eccDNA和線性染色體具有序列同源性 , 功能缺失實驗很難在環形和線性染色體上獨立進行 。 因此解釋eccDNA的分子功能極具挑戰性 。
數據庫平臺包括靶向基因、表觀遺傳調控、調控元件、染色質可及性、染色質相互作用和遺傳變異六大部分 。 CircleBase提供了一個用戶友好的界面 , 用于搜索、瀏覽和分析各種細胞/組織類型中的eccDNA , 為篩選潛在的功能性eccDNA并解釋它們在人類癌癥和其他疾病中的分子機制提供了有力工具 。
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CircleBase數據庫流程圖
此工作由北醫三院、中國科學院北京基因組研究所、武漢大學人民醫院等機構聯合完成 。 北醫三院毛鳳彪研究員、喬杰院士和中科院基因組所李明錕為該論文的通訊作者 , 北醫三院趙曉璐副研究員、中科院基因組所史雷勝博士和武漢大學人民醫院阮莎莎博士為該論文的共同第一作者 。 該研究獲得國家自然科學基金、北京大學臨床醫學+X青年專項基金和北京大學第三醫院臨床重點項目基金資助 。
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劉忠軍教授團隊證明光功能化技術對3D打印多孔鈦合金假體的促成骨改性作用
2022年1月 , 北醫三院劉忠軍教授團隊在Materials science, Biomaterials(生物材料科學)領域排名第一的 Bioactive Materials 雜志正式出版了題為“Surface treatment of 3D printed porous Ti6Al4V implants by ultraviolet photofunctionalization for improved osseointegration”的論著 , 證明了光功能化技術對3D打印多孔鈦合金假體表面的促成骨改性作用 , 為將來光功能化技術在骨骼修復融合領域的應用提供了理論依據 。
3D打印多孔鈦合金內植物在骨缺損修復重建中的重要作用已得到臨床驗證 , 但鑒于鈦合金的金屬惰性 , 其骨整合性能仍有待進一步提高 。 表面改性或可增加鈦合金內植物的骨整合性能 , 但目前尚缺乏理想的實用性改性技術 。 在復習相關文獻并不斷探索的基礎上 , 研究團隊設計了一種基于紫外(UV)光功能化的全向照射儀 , 用于3D打印多孔鈦合金內植物的表面處理 , 并證實了其體外及體內促成骨作用 , 同時對相關機制進行闡述 。
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