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急性髓系白血病（AML）是一種臨床和遺傳異質性疾病 ， 其特征是未成熟白血病細胞骨髓浸潤導致的骨髓衰竭 。 早期的基因組學研究已經幫助解決了 AML 的一些臨床異質性問題并揭示了特定的藥物靶點 ， 但仍然存在許多挑戰 。 部分患者的基因組風險分層和臨床結果之間仍然存在不匹配 ， 需要進一步完善AML分類 ， 改進生物標志物識別和治療分層；另一方面在臨床治療時基因標志物的預測價值有限 ， 缺乏更加準確的預測標志物 。 此外 ， 對很多已知AML突變基因的下游過程和藥物反應研究太少 ， 迫切需要闡明AML的發病機制 ， 尋找新的藥物靶點 。
2022年3月 ， 德國歌德大學的Hubert Serve ， Thomas Oellerich和馬克斯·普朗克生物化學研究所Matthias Mann等團隊合作在Cancer Cell（IF 31.426）上發表題為"The proteogenomic subtypes of acute myeloid leukemia"的研究文章 ， 他們對252例接受統一治療的AML患者骨髓活檢樣本進行蛋白基因組分析 ， 將AML分為5個蛋白亞型 ， 每個亞型都反映出跨越基因組邊界的特定生物學特征 。 其中兩種蛋白亞型與患者預后相關 ， 但沒有一種與特定的基因組畸變相關 。 值得注意的是 ， 一種僅在蛋白質組分析中存在的亞型（Mita-AML）以線粒體蛋白的高表達為特征 ， 會導致不良預后 ， 在強化誘導化療治療后緩解率降低 ， 總生存期縮短 。 深入的功能分析顯示 ， Mita-AML亞型在代謝上與線粒體復合體I依賴的呼吸作用有關 ， 并且對BCL2抑制劑venetoclax的治療更為敏感 。

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Highlights
本研究涉及252例急性髓系白血病細胞的蛋白基因組特征；
鑒定到具有特定生物學特征的五種AML蛋白亞型；
蛋白組學結果顯示Mito-AML是一種獨特的高危亞型；
Mito-AML亞型對線粒體復合物I的靶向藥治療敏感 。
研究材料
252例年齡從18歲到79歲急性髓系白血病患者 ， 分為發現隊列177例和驗證隊列75例 。 收集治療前的骨髓活檢樣本 ， 梯度離心純化骨髓中的單個核細胞（mononuclear cells）
技術路線
步驟1：急性髓系白血病蛋白組學分子分型；
步驟2：多組學整合描繪AML的蛋白基因組學圖譜；
步驟3：在獨立患者隊列中驗證Mito-AML亞型；
步驟4：Mito-AML亞型生物學特征與病理特征分析 。
研究結果
1. 急性髓系白血病蛋白組學分子分型
研究者對發現隊列中的177例患者樣本進行DIA蛋白組學分析 ， 共鑒定到6,522種蛋白 。 通過對蛋白質組數據進行無監督的分層聚類 ， 發現患者可分為6個蛋白亞組 ， 其中C1 和 C2 具有共同特征 ， 故將其合并為一個亞群（C-Mito） 。 GSVA分析顯示各個亞型具有獨特的生物學特征：C-Mito 型高表達的線粒體蛋白和線粒體相關過程；C3 型RNA加工活躍；C4-6 型髓系白細胞活化和免疫反應增強 。 深入分析還發現不同亞型中轉錄因子和激酶的表達模式也存在明顯差異 。 后期臨床相關性分析發現 C-Mito 型患者顯示出更短的總生存期 ， 并且兩個 C-Mito 亞群（C1 ， C2）具有獨立的生存表型 。

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