其次 ， 科赫發現、分離和鑒定了許多的細菌 。 由于科赫掌握了當時細菌學研究的最先進技術 ， 因此 ， 他在細菌的分離鑒定方面是當時成就最大的科學家 。 他先后分離出炭疽桿菌、傷寒桿桿菌、結核桿菌 ， 霍亂弧菌、麻風桿菌、白喉和破傷風桿菌、痢疾桿菌、鼠疫桿菌等許多病原微生物 。
他并未僅僅停留在細菌的分離和鑒定階段 ， 而是對傳染病的發病原理進行了全面的研究 ， 為現代傳染病學的發展作出了巨大的貢獻 。
重點說下結核桿菌 。 結核病是19世紀嚴重威脅人類生命的疾病之一 ， 據統計當時全世界有1/7的人患有結核病 ， 死亡率極高 。 1881年 ， 科赫開始研究這個威脅全世界的疾病 。
圖源：planet-wissen.de

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1882年 ， 在柏林生理學年會上他宣布分離出結核桿菌 ， 并在此后證明了人類的結核病是由結核桿菌感染所致 。 科赫在研究結核病的過程中 ， 系統地提出了明確鑒定某種特有微生物引起某種特定疾病的三條原則 。
即“科赫原則” 。 這三條原則包括：(1)這種微生物以須恒定地同某種疾病的病理癥狀有關 ， (2)此領在病原體中將致病因子完全分離、純化 ， (3)必須將在實驗室獲得的純培養物在健康的動物身上進行接種實驗 。 如果在實驗動物身上出現的疾癘癥狀和病理特點完全和自然患病體相同 ， 才能確定該病的致病因子為該種微生物 。
由子科赫對結核病研究的這些成果 ， 他榮獲了1903年的諾貝爾生理學醫學獎 。
科赫在細菌學領域的開創性業績為他贏得了許多榮譽 。 然而 ， 或許因為太急于攻克結核病的治療難題 ， 1890年8月 ， 科赫在柏林第十屆國際醫學大會上 ， 將還沒有完成實驗的結核菌素作為一種新型抗結核藥向大會作了報道 ， 醫學界為這一成果歡欣鼓舞 ， 許多醫生立即采用結核菌素作為結核病的治療藥物 ， 結果導致不少人成為結核菌素的犧牲品 。 不久 ， 進一步的實驗證明結核菌素只能在結核病的診斷方面起作用 ， 并無治療價值 。 由于科學家的失誤而導致科學研究的失敗 ， 在著名的科學大師身上也是難免的 。
面對挫折 ， 科赫并沒有一蹶不振 ， 而是認真地吸取教訓 。 到埃及和印度進行新的微生物實驗 ， 不僅發現了霍亂弧菌 ， 而且成功地找到了霍亂交叉感染的途徑和有效的控制方法 ， 表現出科學家堅持真理、勇于改正錯誤的優秀品質 。
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