食管癌是嚴重危害人類健康的公共衛生難題 。 全球范圍內 , 因癌去世的患者 , 每二十位中就有一位是死于食管癌[1]!
食管鱗癌占全世界食管癌病例的80%以上 , 在東亞和非洲地區尤其高發 。 其中 ,在中國 , 食管鱗癌是發病率第六 , 死亡率第四的惡性腫瘤[2] 。
食管鱗癌的預后很大程度上取決于確診時的臨床分期 , 早期食管鱗癌經微創治療 , 五年生存率可達90%以上;而 中晚期食管鱗癌經手術、放療和化療后 , 五年生存率目前仍不足30%[3] 。 因此 , 食管鱗癌的早期檢測在食管癌的防治中極其關鍵 , 能為及時干預和有效治療提供寶貴的時間窗口 , 顯著提升患者預后 。
當前 , 食管鱗癌的早篩有鱗狀細胞癌相關抗原(SCC-Ag)[4]等幾種血清標志物 , 但敏感性和特異性差強人意 , 都尚不足以作為獨立的食管癌診斷生物標志物 。 因此 , 迫切需要開發更高效的無創生物標志物 , 用于食管鱗癌的早期檢測 。
miRNA是一類長度約為20-25個核苷酸的非編碼RNA , 能通過轉錄干擾或翻譯抑制 , 調節基因表達 。 由于結構穩定 , 以及在血清中表達豐度高 , miRNA有成為癌癥無創生物標志物的潛力[5] , 是當今挖掘食管鱗癌血清標志物的研究熱點 。
近日 ,中國國家癌癥中心的劉芝華教授聯合美國、日本和南非的科學家 , 在國際頂級醫學期刊 Molecular Cancer 上 , 發表了 食管鱗癌miRNA血清標志物的重要研究成果[6] 。
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論文首頁截圖
他們通過生信分析 ,挖掘和鑒定出食管鱗癌的八種血清高表達miRNA , 并以此構建診斷模型 , 在幾項大型、獨立、多種族、多中心的回顧性和前瞻性隊列中 , 證明 該miRNA組合對食管鱗癌具有明顯優于傳統血清標志物的卓越診斷性能 , 而且經濟便捷 , 具有強大的臨床應用價值 。
這個設計精巧的研究分為五個步驟 , 分別是:miRNA的數據挖掘鑒定、組織表達驗證、血清表達驗證 , 以及診斷模型的回顧性隊列驗證和前瞻性隊列評估 。 研究樣本來自中國、日本和南非的醫院 , 一共約1800份來自食管鱗癌組織和癌旁正常組織 , 以及食管鱗癌患者和健康對照血清的臨床樣本 。
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研究流程
研究伊始 , 劉芝華教授團隊首先選定TCGA和GEO數據庫的三個獨立的食管鱗癌miRNA表達譜數據集 , 進行生物信息學分析 ,挖掘出18個在食管鱗癌組織中高表達的miRNA 。
隨后 , 他們在線鑒定了這18個候選miRNA對食管鱗癌的診斷性能 。 結果顯示 , 在原來的三個食管鱗癌數據集中 ,候選miRNA的AUC都超過0.98 , 表現出優異的診斷潛力 。 此外 , miRNA調控網絡在線分析顯示 , 候選miRNA的靶基因在癌癥相關的信號通路中明顯富集 。
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圖A-C分別為miRNA在三個數據集的表達火山圖 , 圖D為候選miRNA的篩選流程
接著 , 研究人員對這18個候選miRNA進行了線下的組織表達驗證 。 結果證實 , 相比于在癌旁正常組織 , 這18個候選miRNA在食管鱗癌組織中的表達的確顯著上調 。
既然研究的目的是開發食管鱗癌的一種無創液體活檢標志物 , 而非有創的組織活檢標志物 。 那么 , 這些在食管鱗癌組織中高表達的候選miRNA , 有多少也是在患者的血清中高表達 , 從而能夠轉化為液體活檢標志物?
為了評估這18個候選miRNA的轉化潛力 , 研究人員在食管鱗癌患者和健康對照人群中 , 對它們在血清中的表達水平進行了檢測 。 結果顯示 , 這18個miRNA中 ,有8個(miR-103、miR-106b、miR-151、miR-17、miR-181a、miR-21、miR-25和miR-93)在食管鱗癌患者的血清中表達明顯增多 。
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