研究者指出 , 當LDA分數截止值大于4時 , 不同組患者間有顯著差異的細菌物種主要是多種乳酸桿菌(圖3) 。 與其他三組相比 , L.sakei在GERD組中顯著富集(p
大腸桿菌在食管腺癌患者中顯著富集(圖3) 。
圖3在種水平上 , 不同組患者LEfSe分析結果
為驗證上述結果 , 研究者整合這5種特異性菌種(L.sakei、L.curvatus、C.stercoris、B.stercoris和E.coli) , 開發了基于mbDNA的宏基因組食管腺癌診斷工具 。
研究者使用邏輯回歸模型 , 對該工具的診斷性能進行了驗證 。 ROC曲線顯示 , 該工具對GERD和食管腺癌的鑒別表現出優秀的性能 , AUC值為0.89 , 最佳靈敏度為60% , 特異性為95%(圖4) 。

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【BJC:科學家首次發現,血液微生物DNA可用于食管癌的早篩和預后!】圖4宏基因組工具表現出優秀的食管腺癌早篩效果
那么宏基因組能否用于預測食管腺癌患者生存期呢?研究者以食管腺癌患者總生存期(OS)是否達到24個月為標準 , 將患者分為兩類:OS
研究者對不同類別患者的樣本進行了LEfSe分析 。 研究者發現 , 沙門氏菌噬菌體球衣(Salmonellaphagejersey)和大腸桿菌病毒P1(EscherichiavirusP1)在OS≥24個月組中顯著富集(圖5a) 。 隨后 , 研究者構建了一個包含這兩種噬菌體和大腸桿菌的宏基因組工具 , 用于預測食管腺癌患者的生存期 。
當該工具與患者臨床TNM分期相結合時 , ROC曲線顯示 , 該工具對鑒別OS≥24個月的患者表現出不俗的性能 , AUC為0.84 , 最佳靈敏度86% , 特異性65%(圖5b) 。
此外 , 與單獨使用臨床TNM分期相比 , 當TNM分期與宏基因組結合時 , 后者能夠預測更長的OS , 風險比(HR)為6.23(p
(圖5c) 。

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圖5宏基因組特征可作為食管腺癌患者預測OS的生物標志物
總的來說 , 該研究首次表明 , 基于循環mbDNA的宏基因組在食管腺癌早篩和預后診斷中具有強大的生命力 。 此外 , 該研究鑒定的與食管腺癌診斷和預后相關的重要微生物 , 未來或可成為潛在的治療靶點 。

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