新型冠狀病毒Omicron變異株病原學及流行病學研究進展( 三 )


3.疾病結局:
在Omicron變異株流行早期 , 多項流行病學研究顯示 , Omicron變異株引起的住院、重癥和死亡風險低于先前的變異株 。 南非前瞻性隊列研究顯示 , 在住院患者中 , 與先前Delta變異株感染者相比 , Omicron變異株感染者發生重癥的概率顯著降低70%(OR=0.3 , 95%CI:0.2~0.5)[20] 。 英國前瞻性隊列研究顯示 , 與Delta變異株相比 , Omicron變異株感染導致的就診風險降低44% , 住院和死亡風險分別降低59%和69%[21] 。 美國回顧性隊列研究顯示 , 相比Delta變異株 , Omicron變異株感染者總體入院風險下降41% , 其中 , 入住重癥監護室風險下降50% , 機械通氣風險下降64% , 死亡風險下降79%[22] 。 上述研究均基于國家性的大型人群數據開展 , 并調整了年齡、性別、疫苗接種和新冠病毒感染史等可能與疾病嚴重性相關混雜因素 。
對Omicron變異株不同亞型的研究顯示 , 不同亞型感染導致的疾病嚴重程度無顯著差異 。 美國研究顯示 , 與BA.1/BA.1.1亞型相比 , BA.2感染導致的疾病嚴重程度無顯著差異[22] 。 南非研究顯示 , BA.4/5感染者在入院和發展成重癥風險方面與BA.2類似 。 在病死率方面 , 研究發現原始株、Beta、Delta、BA.1和BA.4/5變異株的病死率分別為5.3%、6.9%、6.4%、2.5%和1.9% 。 與BA.1相比 , BA.4/5變異株感染者病死率差異無統計學意義(HR=1.12 , 95%CI:0.93~1.34)[23] 。 感染新冠病毒后發展為重癥危險因素包括男性、老年、肥胖、心血管病和呼吸系統疾病等[24-26] 。 我國香港地區Omicron變異株流行期間 , 對2021年12月31日至2022年9月28日的9943例新冠肺炎死亡病例分析顯示 , 死者中位年齡為86歲 , 91%患有長期慢性病 , 69%未接種過任何疫苗或接種過1劑疫苗但未滿14d , 28%未接種疫苗加強針[27] 。 可見 , 未接種疫苗、老年、合并慢性病為感染Omciron變異株后重癥和死亡的重要危險因素 。
三、
Omicron變異株感染的流行特征
1.優勢毒株:
2022年9月3日至10月3日 , 共有超10萬2019-nCoV序列信息提交全球禽流感基因共享數據庫(Globalinitiativeonsharingallinfluenzadata , GISAID) , 其中Omicron變異株序列占99.9%[1] 。 Omicron變異株首次于2021年11月在南非檢出 , 隨后取代Delta變異株持續流行演變 。 2022年2月 , BA.2亞型迅速流行全球 , 成為優勢毒株 。 BA.5亞型于2022年2月首次被南非研究者發現后 , 造成了感染數量的增加 , 截至7月已替代BA.2成為全球新的優勢毒株 。 BA.4和BA.5早在5月已成為南非優勢毒株 , 每日增長優勢(dailygrowthadvantage)比BA.2分別高0.08d和0.12d[28] 。 2022年9月5-11日(第36周)的GISAID數據顯示 , BA.5及其后代譜系占Omicron變異株序列的80.8% , BA.4及其后代譜系占7.8% , BA.2及其后代譜系占3.1%[1] 。 美國CDC新冠病毒監測數據顯示 , 當前美國優勢毒株仍為BA.5 , 但BA.5的檢出比例自8月中旬到達頂峰(86.7%)后 , 在10月16-22日的周報中已經下降至62.2% 。 與此同時 , BA.5亞型新的分支BQ.1、BQ.1.1和BF.7檢出比例迅速上升 , 同期周報數據顯示分別占9.4%、7.2%和6.7% , 位列美國第三、第四和第五 , 位列第二位的為BA.4.6(占12.8%)[29] 。 聚焦國內 , 2022年2月以來 , 我國主要流行的毒株為BA.2及其后代譜系;5月 , 上海市從境外輸入病例中首次檢出BA.5 , 7月BA.5引發國內首次本土疫情;9月 , 呼和浩特市現首例BF.7本土新冠病毒感染者 , 是BF.7變異株首次在國內引起本土疫情 。 BF.7是Omicron變異株二代譜系 , 其在BA.4/5的基礎上存在額外突變 , 免疫逃逸能力更強 , 其具體特性和重要性有待觀察 。
2.傳播特征:
研究顯示 , Omicron變異株傳染力和傳播速度比原始株和其他VOC更強 。 基本再生數(R0)是描述病毒傳染力的指標 , R0越大病毒的傳染力越強 。 病毒傳染的序列間隔(serialinterval)和代際間隔(generationtime)會影響其傳播速度 , 其數值越小傳播速度越快 。 新冠病毒原始株、Delta、Omicron變異株的R0分別為2.2[30]、3.2[30]、9.5[31] , 表明傳染力不斷增強 。 我國研究者基于北京市2022年3月報告的78例具有明確傳播鏈的Omicron變異株感染者信息 , 分析得出Omicron變異株序列間隔時間中位數為3.0d , 明顯短于原始株(不同研究中位數介于4~6d)[32] 。 英國研究發現Omicron變異株的指數增長率(exponentialgrowthrate)約為0.34(95%CI:0.33~0.35)/d , 感染病例的倍增時間為2d(Delta變異株的倍增時間為5.2d)[10] 。 南非研究顯示 , 在Omicron變異株主導的疫情期間 , 病例的增加速度更快 , 該地區從首例病例出現到疫情高峰的時間為1個月 , 而Delta疫情時為2個月[33] 。 以上研究均提示相對于Delta變異株 , Omicron變異株的傳播速度更快 。 我國香港地區基于BA.1和BA.2流行期間的研究則表明了不同亞型傳播速度的差異 , 研究發現BA.1和BA.2的平均序列間隔時間分別為3.30d和2.72d , BA.1的平均代際間隔時間為2.36d[34];既往基于廣州市Delta變異株流行期間的數據研究顯示Delta變異株的平均代際間隔時間為2.9d[30] 。 提示BA.2的傳播速度較BA.1快 , 均明顯強于Delta變異株 。