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新型冠狀病毒Omicron變異株病原學及流行病學研究進展

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引用本文：廖春曉,王波,呂筠,李立明.新型冠狀病毒Omicron變異株病原學及流行病學研究進展[J].中華流行病學雜志,2022,43(11):1691-1698.
DOI:10.3760/cma.j.cn112338-20220929-00829
新型冠狀病毒Omicron變異株病原學及流行病學研究進展
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廖春曉,王波,呂筠,李立明
摘要
新型冠狀病毒Omicron變異株病原學及流行病學研究進展
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新型冠狀病毒Omicron變異株病原學及流行病學研究進展
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目前新型冠狀病毒Omicron變異株為全球流行的優勢株 ， Omicron變異株不斷出現新的亞型 ， 且攜帶更多的突變位點 。 與原始株和其他值得關切的變異株相比 ， Omicron變異株感染的致病特征和流行特征發生了明顯的改變 。 Omicron變異株致病性和毒性減弱 ， 免疫逃逸能力陡增 ， 傳播速度更加迅速 ， 更易通過物體表面和氣溶膠媒介進行傳播 。 人群感染后潛伏期縮短 ， 無癥狀和輕癥者居多 ， 住院和死亡風險降低 。 本文重點梳理Omicron變異株的致病特征和流行特征 ， 以期為Omicron變異株的科學防控提供參考 。
【關鍵詞】Omciron變異株；免疫逃逸；致病性；流行病學；疫苗
新型冠狀病毒Omicron變異株病原學及流行病學研究進展
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前言
新型冠狀病毒（新冠病毒）引發的新冠病毒肺炎（新冠肺炎）大流行仍在全球蔓延 。 截至2022年10月2日 ， 全球累計感染人數超6億 ， 死亡人數超650萬[1] 。 新冠病毒持續進化和變異 ， 先后出現Alpha（B.1.1.7）、Beta（B.1.351）、Gamma（P.1）、Delta（B.1.617.2）及Omicron（B.1.1.529）變異株 。 B.1.1.529變異株最早于2021年11月在南非檢出 ， 該變異株具有大量的突變 ， 傳播速度快 ， WHO根據新冠病毒進化技術咨詢小組的建議 ， 將B.1.1.529列為值得關切的變異株（variantsofconcern ， VOC） ， 并命名為Omicron變異株[2] 。 Omicron持續變異 ， 不斷出現新的亞型 ， 主要包括BA.1 ， BA.2 ， BA.3 ， BA.4和BA.5亞型及其后代譜系 。 Omicron變異株不同亞型特征的比較見表1 。 本文對Omicron變異株及其亞型的病原學特點、感染的致病特征和流行病學特征及疫苗的保護效果方面進行綜述 ， 以期為Omicron變異株的科學防控提供參考 。
新型冠狀病毒Omicron變異株病原學及流行病學研究進展
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一、
Omicron變異株病原學特點
1.遺傳變異：
Omicron（B.1.1.529）變異株來自B.1.1譜系 ， 為新冠病毒的進化支系之一 。 從新冠病毒基因序列的進化樹來看 ， BA.1、BA.2和BA.3屬于Omicron變異株不同的進化分支 ， 而BA.4和BA.5則是在BA.2的基礎上進化而來 ， 由于其遺傳變異的相似性 ， 經常把BA.4和BA.5合并稱為BA.4/5[3] 。
新冠病毒入侵人體后 ， 主要依靠其表面的刺突蛋白上的受體結合域（receptorbindingdomain ， RBD）識別宿主細胞受體血管緊張素轉化酶2（angiotensinconvertingenzyme2 ， ACE2） ， 并與之結合感染宿主細胞 。 刺突蛋白是唯一修飾病毒粒子表面的病毒蛋白 ， 也是自然感染和疫苗設計的主要抗原靶標[4] 。 與原始株相比 ， BA.1在刺突蛋白中含有34個突變 ， 這些刺突蛋白突變會引起其病毒學特征的改變 ， 如復制能力和毒性降低 ， 傳染力增強[5] 。 隨后的Omicron變異株亞型均保留這些突變 。 研究顯示 ， BA.1和BA.2由于E484A和H655Y突變 ， 導致利用跨膜絲氨酸蛋白酶2（TMPRSS2）的能力下降；S375F和H655Y突變降低了刺突蛋白介導的細胞融合性 ， 影響病毒入侵能力從而導致其復制能力減弱[5] 。 BA.4/5與BA.2相比增加了L452R、F486V和R493Q突變 ， 其中L452R突變是此前Delta變異株的重要突變位點 ， 有利于病毒躲避針對RBD2類和3類區域的抗體 ， 是導致高免疫逃逸能力的關鍵突變位點之一[3] 。 此外 ， BA.4/5攜帶的F486V突變還有利于逃逸針對RBD的1類和2類抗體 ， R493Q回復突變又增加了RBD與受體結合的親和力 ， 進而提高了BA.4/5的適應性[3] 。