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新研究試圖解釋為什么前列腺癌的嚴重程度因種族而異

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來源:谷歌共享圖庫
2020年 , 全球前列腺癌是男性中第二頻繁的癌癥 , 也是癌癥死亡的第五大原因 。
這是2018年澳大利亞最常診斷的癌癥(估計2022年仍如此);男性在85歲時被診斷出患有前列腺癌的風險為6分之一(或17%) 。
但并非地球上的每個人都受到該疾病類似影響 , 事實上 , 不同種族的前列腺癌的嚴重程度存在顯著差異——特別是在撒哈拉以南非洲 , 那里的死亡率是全球平均水平的2.7倍 。
但是祖先、地理還是兩者的結合導致了這種變化?為了解決這個問題 , 研究人員對南非、巴西和澳大利亞捐贈者的前列腺癌腫瘤的遺傳學進行了測序 。
該結果發表在《自然》和《基因組醫學》的兩項新研究中 , 確定了新的前列腺癌亞型和癌癥驅動因素 , 可以區分患者的祖先 , 并預測癌癥是否會危及生命 。
悉尼大學查爾斯·珀金斯中心和澳大利亞醫學與衛生學院老年經濟學家兼皮特前列腺癌研究主席VanessaHayes教授表示:“他們對前列腺癌的理解受到對西方人口的研究關注的嚴重限制 。 ”
“他們發現非洲人受到更多和范圍的后天遺傳改變(包括癌癥驅動因素)的影響 , 這對管理和治療前列腺癌時的祖先考慮產生了重大影響 。 ”
非洲人的前列腺癌腫瘤有更多的突變
研究人員對從183名患者(包括123名南非人、53名澳大利亞人和7名巴西人)收集的未經治療的前列腺癌樣本的基因組進行了測序 , 并能夠識別出約200萬種與癌癥有關的遺傳變異(突變) 。

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VanessaHayes教授正在檢查研究中使用的前列腺癌患者的血液樣本 。 來源:StephanieZingsheim
“這項研究的獨特之處在于 , 他們在同一批次中對非洲人和澳大利亞人進行了測序——這意味著他們閱讀了腫瘤和血液的整個DNA序列 , 一切都是在澳大利亞完成的 。 ”
“這真的很重要 , 因為這意味著樣本通過一條技術管道和一個分析管道 。 ”
這是必要的 , 以便將研究中所有患者的基因組數據進行比較 , 無論是來自澳大利亞、巴西還是南非的患者 。
“大多數澳大利亞男性 , 實際上十分之九 , 將死于前列腺癌 , 而不是前列腺癌 。 我們不知道陣容中的十名澳大利亞人有什么區別 , 所以他們實際上必須遠離澳大利亞 , 試圖了解更多背景 。 ”
他們發現 , 與歐洲血統的人相比 , 非洲血統的人的腫瘤之間存在顯著差異 。 在非洲人中 , 腫瘤的突變性更大——它們的腫瘤突變負擔更高 。
根據Hayes的說法 , 這很重要 , 因為小突變事件在前列腺癌中通常不像在黑色素瘤或肺癌中那么常見 。 而且 , 與紫外線照射黑色素瘤或吸煙肺癌不同 , 沒有已知的前列腺癌致癌驅動因素 。
“他們在非洲人身上看到的是 , 這些小變化的負擔高于澳大利亞人 , 這提出了一個想法:非洲是否存在一些致癌物 , 一些環境暴露 , 這正在導致該地區的前列腺癌的侵襲性?
“所以 , 如果能識別出來 , 那么也許這就是十名澳大利亞男子在他們有生之年也接觸到的 。 ”
前列腺癌亞型分類的新方法
使用計算數據科學 , 該團隊能夠將前列腺癌分為四種不同的亞型 , 稱為全局突變亞型(GMS) 。
悉尼大學計算生物學家、《自然》論文的第一作者WeerachaiJaratlerdsiri博士表示:“將獨特的數據集與歐洲和中國癌癥基因組的最大公共數據來源相結合 , 使他們首次將非洲前列腺癌基因組景觀置于全球背景下 。 ”
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