均一性(>0.2X測序深度占比):測序深度超過平均測序深度0.2倍的位點所占比例 , 表征目標區域測序覆蓋的均一程度 。
序列mapping率:比對到參考基因組(Hg19)的序列數目占比 。
測序堿基Q30比例:測序數據中堿基錯誤率在千分之一以下的占比 。
常見英文縮寫:
【體細胞|怎樣看懂一份基因檢測報告:報告常見名詞解釋】NGS (Next Generation Sequencing):下一代測序技術 , 也稱為高通量測序技術 。
PD-1(programmed cell death protein 1):程序性細胞死亡蛋白1 , 也稱為CD279(分化簇279) , 是一種重要的免疫抑制分子 。
PD-L1(Programmed cell death 1 ligand 1):程序性細胞死亡-配體1也稱為表面抗原分化簇274(cluster of differentiation 274 , CD274)或 B7同源體(B7 homolog 1 , B7-H1) , 是人類體內的一種蛋白質 , 由CD274基因編碼 。
HRR(Homologous recombination repair):同源重組修復 ,是DNA雙鏈損傷的核心修復方式之一 , 其通過對DNA的同源鏈的重組 , 完成對雙鏈損傷部位的修復 。
HRD(Homologous recombination repair defect):同源重組修復缺陷 , 當DNA出現雙鏈斷裂時 , 細胞失去了通過同源重組的方式對斷裂進行修復的能力 。
MRD(Minimal residual disease):微小殘留病灶 , 指癌癥患者在治療中或治療后仍有殘留的惡性細胞存在 , 是癌癥復發的主要原因 。
dMMR(mismatch-repair deficiency):錯配修復缺陷 。 錯配修復是由一系列高度保守的基因及其表達的產物酶構成 , 具有維持DNA復制的高保真度和基因組穩定性、降低自發突變的功能 。
PARP(poly-ADP-ribose polymerase)抑制劑:聚腺苷二磷酸-核糖聚合酶抑制劑 , PARP抑制劑通過抑制腫瘤細胞DNA損傷修復、促進腫瘤細胞發生凋亡 , 從而可增強放療以及烷化劑和鉑類藥物化療的療效 。
HGVS(Human Genome Variation Society):人類基因組變異協會 , HGVS變異命名規則是目前學術界所公認的突變命名規則 。
NCCN(National Comprehensive Cancer Network):美國國立綜合癌癥網絡 , 每年發布的各種惡性腫瘤臨床實踐指南 , 得到了全球臨床醫師的認可和遵循 。
AMP(Association for Molecular Pathology):美國分子病理學會 。
ASCO(American Society of Clinical Oncology):美國臨床腫瘤學會 。
CAP(College of American Pathologists):美國病理學家學會 。
CSCO(Chinese Society Of Clinical Oncology):中國臨床腫瘤學會 。
ACMG(American College of Medical Genetics and Genomics):美國醫學遺傳學與基因組學學會
參考資料:百度百科;維基百科 。
仁東醫學六周年全新企劃之《報告解讀系列:怎樣看懂一份基因檢測報告》共有6課 , 作為該系列的第一課:報告常見名詞解釋的科普 , 到這里就結束了 。 當然 , 僅僅知道這些名詞的意思是遠遠不夠的 , 在后續的欄目中 , 遺傳咨詢部將會給大家逐步推送報告解讀的進階知識 , 幫助患者一步步地去讀懂自己的基因檢測報告 。 如果您對本期內容有任何專業方面的疑問 , 歡迎在評論區留言 , 小編也會在第一時間解答您的疑惑 。
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2021年12月29日(下周三)早上8點鐘 。 “仁東醫學六周年全新企劃”第五期 , 將由仁東醫學質量管理部來和大家談談《您完全可以信任的實驗室管理體系:人員能力-實驗員要具備哪些能力?》 。 敬請關注!
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