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預測新冠如何突變的人

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預測新冠如何突變的人
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當下 ， 奧密克戎正在流行 ， 我們在經歷病毒離每個人最近的時刻 。
奧密克戎究竟是什么？它如何演變而來 ， 有怎樣的特性 ， 有怎樣的變異規律？人類對這個病毒的認識到了哪個階段？而它又要走向何處？以一種科學的視角 ， 了解這個病毒的方方面面 ， 或許可以幫助我們更理性地應對疫情 。
曹云龍是北京大學生物醫學前沿創新中心副研究員、北京昌平實驗室領銜科學家 。 曹云龍原本致力于單細胞基因組學的研究 ， 2019年底 ， 從哈佛大學博士畢業回國時 ， 因為新冠疫情到來 ， 遂而轉向病毒的研究 。 三年來 ， 他探究新冠病毒的免疫應答 ， 也研究相關的抗體藥物與疫苗 。
2020年 ， 新冠病毒流行期間 ， 曹云龍與團隊發現了DXP-593、DXP-604兩個具有不重疊表位的抗體 ， 并進行體外合成 ， 作為「抗體雞尾酒療法」 。 但奧密克戎病毒太「狡猾」 ， 免疫逃逸能力極強 ， 這兩個單抗藥物已經同時被顯著逃逸 。 這讓整個團隊很懊惱 ， 也促使他們進一步思考和探究 。 這兩年多來 ， 他始終在問：「抗體藥物的篩選是否有更好的辦法？對病毒的理解如何還能更深入？是不是還有別的研究思路？」
今年 ， 曹云龍基于自主構建的病毒突變預測模型 ， 構建了一些「假病毒」 ， 準確預測了BA.2.75與BA.5未來的進化趨勢 。 今年10月 ， BQ.1.1毒株在尼日利亞被發現并開始大流行 ， 一個月后 ， CH.1.1變異毒株（目前中國香港主要流行株）也被發現 ， 而這兩支毒株 ， 早在今年7月 ， 已經出現在曹云龍的預測名單里 ， 與他構建的假病毒的序列高度一致 。 《Nature》雜志因此將曹云龍評選為年度十大人物 ， 稱他為「COVIDpredictor（新冠預測者）」 ， 稱贊他的工作使得我們能跟上病毒進化的腳步 。
近日 ， 圍繞奧密克戎的相關問題和最新研究 ， 我們專訪了曹云龍 。 這個年僅31歲的科學家很少直接給出「是」或是「否」的答案 ， 而是會在每一個結論前加許多限定性條件 。 如果沒有明確的研究結論 ， 他也會誠懇地說 ， 「你要允許科學家也有『不知道』」 ， 而科研 ， 就是在解決如此之多的「不知道」 。
以下是《人物》與曹云龍的對話：
文｜馮穎星
編輯｜楚明
圖｜視覺中國（除特殊標注外）
狡猾的奧密克戎
《人物》：從2019年12月最早認識新冠病毒 ， 到現在廣泛流行的奧密克戎 ， 新冠病毒都經歷了怎樣的變異？到現在 ， 奧密克戎又是什么 ， 是如何演變而來的？
曹云龍：新冠病毒的流行經歷了從原始株-Alpha變異株-Delta變異株-Omicron變異株的過程 ， 但在此期間出現的變異株遠不止這些 ， 這些只是WHO（世界衛生組織）命名的值得關注的變異株（VOC） 。 以寥寥數語描述病毒的整個變異歷程是不可能的 。
總而言之 ， 新冠病毒攜帶的突變在不斷累積 ， 而奧密克戎這一高度突變的變異株據推測是在免疫缺陷人群中演化而來的 。 奧密克戎株內部也已經進化出諸多差異頗大的支系 ， 最早出現的分支稱作BA.1 ， 如今在北京流行的BF.7的全稱是BA.5.2.1.7 ， 已經是奧密克戎進一步高度進化的產物 。 而目前國際上廣泛流行的奧密克戎BQ.1.1的全稱是BA.5.3.1.1.1.1.1.1 ， 進化程度極高 。
《人物》：為什么奧密克戎的傳播速度如此之快 ， 會在短時間內造成感染率的急劇攀升？
曹云龍：與此前變異株相比 ， 奧密克戎具有極強的免疫逃逸能力 ， 這也是它的「狡猾」之處 。 通常情況下 ， 人體在接種疫苗和自然感染后會建立免疫屏障 ， 如體液免疫中的抗體 ， 當病毒再次入侵時可以快速將病毒清除 。 而病毒在這些中和抗體的壓力下進化 ， 逃逸能力強的自然有生存優勢 ， 這就表現為奧密克戎產生突變來逃逸人體建立的免疫屏障 ， 導致中和抗體失效 ， 出現突破感染和再感染 。